Forskargrupp Michael Sundström
SGC Karolinska fokuserar på translationell medicinsk forskning inom kroniska inflammatoriska sjukdomar, neurodegenerativa sjukdomar och leverfibros för att möjliggöra framtida läkemedelsutveckling. Vi tillhör Structural Genomics Consortium (SGC), ett offentlig-privat partnerskap som stödjer upptäckten av nya läkemedel genom öppen vetenskap. Vi forskar på i) patient-deriverade cellsystem ii) utveckling av rekombinanta proteiner och antikroppar samt iii) validering av kemogenomiska substanser.
Translationell medicinsk forskning inom kroniska inflammatoriska sjukdomar
SGC Karolinska-laboratoriet fokuserar på tre vetenskapliga områden i) cellbaserade analyser av patient-deriverade cellsystem ii) utveckling av rekombinanta antikroppar mot selekterade målproteiner från SGC-nätverket och samarbetspartners samt iii) validering av kemogenomiska substanser mot specifika proteiner och proteinfamiljer. Vi har ett särskilt intresse av att studera inflammation och autoimmuna sjukdomar baserade på inflammatoriska processer inklusive inflammatorisk tarmsjukdom, neuro-inflammation och leverfibros.
SGC Karolinska-laboratoriet, under ledning av prof. Michael Sundström, tillhör institutionen för medicin, Solna vid Karolinska Institutet (KI), och är beläget vid Centrum för Molekylär Medicin (CMM).
SGC Karolinska-laboratoriet fokuserar på translationell medicinsk forskning inom kroniska inflammatoriska sjukdomar, neurodegenerativa sjukdomar och leverfibros för att möjliggöra framtida läkemedelsutveckling. Vi är en del av Structural Genomics Consortium (SGC), ett offentlig-privat partnerskap som stödjer upptäckten av nya läkemedel genom en öppen vetenskapsmodell. Vår forskning fokuserar på tre vetenskapliga områden i) cellbaserade analyser av patient-deriverade cellsystem ii) utveckling av rekombinanta antikroppar mot selekterade målproteiner samt iii) validering av kemogenomiska substanser mot specifika proteiner och proteinfamiljer såsom GPCR’er och jonkanaler. Vi har ett särskilt intresse av att studera inflammation och autoimmuna sjukdomar baserat på inflammatoriska processer inklusive inflammatorisk tarmsjukdom, neuro-inflammation och leverfibros. Vi har forskningsverksamhet inom bioteknik, protein- och antikroppsproduktion, cellodling, patientderiverade cellbaserade analyser och screening samt inom ramen för EUbOPEN projektet även verksamhet inom kemogenomik och keminformatik i samarbete med Evert Homan (institutionen för onkologi och patologi, KI). All forskning bedrivs genom så kallad öppen vetenskap där alla forskningsdata och resultat omedelbart görs öppet tillgängliga för forskarsamhället.
Gruppmedlemmar
Michael Sundström
Senior lab manager/ forskargruppsledare- Oliver Arnolds, postdoc
- Kristina Edfeldt, research coordinator
- Opher Gileadi, team leader
- Ali Hazrat, IT-technician
- Mohammad Ali Okhovat, PhD student
- Mingmei Shang, research coordinator
- Sonia Youhanna, postdoc
- Kang-cheng Liu, postdoc
EUbOPEN – Enabling and Unlocking Biology in the Open
EUbOPEN är ett konsortium som beviljats nästan 66 miljoner euro (690 miljoner kronor) av europeiska Innovative Medicines Initiative (IMI) och dess samarbetspartners. Medlen ska användas till att utveckla, testa och tillgängliggöra kemiska substanser och andra forskningsverktyg som kan bana väg för nya läkemedel och behandlingar av sjukdomar inom bland annat inflammation och cancer.
Projektet, som döpts till ”Enabling and Unlocking biology in the OPEN” (EUbOPEN), involverar 22 partners från akademin och industrin som tillsammans ska ta fram och validera högkvalitativa läkemedelslika kemiska substanser och andra forskningsverktyg som till exempel antikroppar. Michael Sundström, forskningschef SGC Karolinska, leder verksamheten tillsammans med andra forskare på Karolinska Institutet.
Konsortiet kommer även att testa och analysera substanserna i sjukdomsrelevanta modeller av mänsklig vävnad inom områdena immunologi, onkologi och neurovetenskap. Resultat, kemiska substanser, antikroppar, analysprotokoll och tillhörande forskningsdata görs öppet tillgängliga för forskarsamhället utan begränsningar.
Projektets finansiering kommer dels från IMI, och dels från läkemedelsindustrins europeiska samarbetsorganisation EFPIA, IMI-associerade partners och andra internationella partners. IMI är ett samarbete mellan EU och den europeiska läkemedelsindustrin, vars syfte är att påskynda utvecklingen av och tillgången till nya innovativa läkemedel inom områden där behoven är särskilt stora.
Samarbeten
SGC uppmuntrar samarbeten med laboratorier över hela världen, fokuserade på proteiner av medicinsk relevans och deras funktionella modulatorer, såsom småmolekylära hämmare och antikroppar.
SGC Karolinska-laboratoriet har idag ett stort samarbetsnätverk vid Karolinska Institutet och samverkande universitet. Vårt arbete inom kemogenomik sker vid institutionen för onkologi och patologi i laboratorier på Science for Life Laboratory. Vårt samarbetsnätverk för postdoktorer stödjer postdoktorer i forskargrupperna Maja Jagodic (institutionen för klinisk neurovetenskap, KI), Volker Lauschke och Gunnar Schulte (institutionen för fysiologi och farmakologi, KI), Pekka Katajisto (institutionen för cell och molekylärbiologi, KI), Eduardo Villablanca (insitiutionen för medicin, Solna, KI), David Gloriam (Köpenhamns universitet) och Rob Leurs & Barbara Zarzycka (Free University Amsterdam).
- Maja Jagodic https://ki.se/en/cns/maja-jagodics-research-group
- Pekka Katajisto https://www.katajisto-lab.com/
- Volker Lauschke https://ki.se/en/fyfa/personalized-medicine-and-drug-development.
- Anna-Lena Gustavsson https://www.scilifelab.se/facilities/cbcs
- Evert Homan http://helleday.org/
- Mats Ohlin, Lund University https://www.immun.lth.se/research-new/senior-researchers/mats-ohlin/
- David Gloriam, University of Copenhagen https://drug.ku.dk/disciplines/peptides-and-proteins/gloriam-group/
- Rob Leurs & Barbara Zarzycka, Free University Amsterdam https://research.vu.nl/en/persons/rob-leurs
- Daniel Martinez Molinas, Pelago Bioscience https://www.pelagobio.com/
Forskninsstöd
- Innovative Medicines Initiative (IMI)
- Bill and Melinda Gates Foundation
- The Structural Genomics Consortium
Utvalda publikationer
Cellular shape reinforces niche to stem cell signaling in the small intestine.
Pentinmikko N, Lozano R, Scharaw S, Andersson S, Englund JI, Castillo-Azofeifa D, Gallagher A, Broberg M, Song KY, Sola Carvajal A, Speidel AT, Sundstrom M, Allbritton N, Stevens MM, Klein OD, Teixeira A, Katajisto P
Sci Adv 2022 Oct;8(41):eabm1847
Circulating Levels of Interferon Regulatory Factor-5 Associates With Subgroups of Systemic Lupus Erythematosus Patients.
Idborg H, Zandian A, Ossipova E, Wigren E, Preger C, Mobarrez F, Checa A, Sohrabian A, Pucholt P, Sandling JK, Fernandes-Cerqueira C, Rönnelid J, Oke V, Grosso G, Kvarnström M, Larsson A, Wheelock CE, Syvänen AC, Rönnblom L, Kultima K, Persson H, Gräslund S, Gunnarsson I, Nilsson P, Svenungsson E, Jakobsson PJ
Front Immunol 2019 ;10():1029
Generation and validation of recombinant antibodies to study human aminoacyl-tRNA synthetases.
Preger C, Wigren E, Ossipova E, Marks C, Lengqvist J, Hofström C, Andersson O, Jakobsson PJ, Gräslund S, Persson H
J Biol Chem 2020 Oct;295(41):13981-13993
Identifying novel B-cell targets for chronic inflammatory autoimmune disease by screening of chemical probes in a patient-derived cell assay.
Sundström Y, Shang MM, Panda SK, Grönwall C, Wermeling F, Gunnarsson I, Lundberg IE, Sundström M, Jakobsson PJ, Berg L
Transl Res 2021 Mar;229():69-82
Anti-Inflammatory Properties of Chemical Probes in Human Whole Blood: Focus on Prostaglandin E2 Production.
Bergqvist F, Sundström Y, Shang MM, Gunnarsson I, Lundberg IE, Sundström M, Jakobsson PJ, Berg L
Front Pharmacol 2020 ;11():613
A genetics-led approach defines the drug target landscape of 30 immune-related traits.
Fang H, , De Wolf H, Knezevic B, Burnham KL, Osgood J, Sanniti A, Lledó Lara A, Kasela S, De Cesco S, Wegner JK, Handunnetthi L, McCann FE, Chen L, Sekine T, Brennan PE, Marsden BD, Damerell D, O'Callaghan CA, Bountra C, Bowness P, Sundström Y, Milani L, Berg L, Göhlmann HW, Peeters PJ, Fairfax BP, Sundström M, Knight JC
Nat Genet 2019 Jul;51(7):1082-1091
Patients with anti-Jo1 antibodies display a characteristic IgG Fc-glycan profile which is further enhanced in anti-Jo1 autoantibodies.
Fernandes-Cerqueira C, Renard N, Notarnicola A, Wigren E, Gräslund S, Zubarev RA, Lundberg IE, Lundström SL
Sci Rep 2018 Dec;8(1):17958
Preclinical target validation using patient-derived cells.
Edwards AM, Arrowsmith CH, Bountra C, Bunnage ME, Feldmann M, Knight JC, Patel DD, Prinos P, Taylor MD, Sundström M,
Nat Rev Drug Discov 2015 Mar;14(3):149-50
Recently targeted kinases and their inhibitors-the path to clinical trials.
Knapp S, Sundström M
Curr Opin Pharmacol 2014 Aug;17():58-63
Crystal structures of histone demethylase JMJD2A reveal basis for substrate specificity.
Ng SS, Kavanagh KL, McDonough MA, Butler D, Pilka ES, Lienard BM, Bray JE, Savitsky P, Gileadi O, von Delft F, Rose NR, Offer J, Scheinost JC, Borowski T, Sundstrom M, Schofield CJ, Oppermann U
Nature 2007 Jul;448(7149):87-91