Om vår forskning
Vi använder beräkningsbaserade metoder för att förstå cancerns biologi och förbättra molekylära biomarkörer för precisionsonkologi. Vår forskning är främst inriktad på bröstcancer, men vi använder också stora cancerövergripande dataset för att identifiera biologiska principer som är gemensamma för olika tumörtyper. Ett centralt mål för vår forskning är att fastställa när molekylär information kan tillföra kliniskt relevant kunskap utöver etablerade patologiska och kliniska markörer. Vår pågående forskning är inriktad på tre sammanlänkade områden:
- Cancerbiologi med fokus på cellcykeln: Vi använder transkriptomik på bulk- och encellsnivå för att undersöka tumörheterogenitet och cellcykelaktivitet samt hur dessa hänger samman med tumörbiologi och patientutfall.
- Tumörens mikromiljö: Vi undersöker sammansättningen och den rumsliga organisationen av immunceller och stromaceller samt hur interaktioner mellan tumörceller och andra celler är kopplade till prognos och behandlingssvar.
- AI, digital patologi och biomarkörer: Vi integrerar histopatologiska bilder med genomiska, transkriptomiska och kliniska data för att utveckla beräkningsbaserade biomarkörer och undersöka vilka molekylära egenskaper som kan utläsas direkt ur tumörvävnad som samlas in inom rutinsjukvården.
Inom dessa områden kombinerar vi stora kliniska kohorter med genomik, transkriptomik, beräkningsbaserad patologi och maskininlärning. Vårt långsiktiga mål är att omsätta komplexa molekylära data i robusta biomarkörer som förbättrar patientstratifieringen och bidrar till en mer individanpassad cancervård.