Nicholas Tobin
Om mig
Jag är senior forskare och forskargruppsledare vid Karolinska Institutet med fokus på cancergenomik, beräkningsbiologi och translationell cancerforskning. Min forskning syftar till att utveckla biomarkörer för förbättrad patientstratifiering inom cancer genom att integrera molekylära och kliniska data för att förstå sjukdomsutveckling, behandlingssvar och långtidsprognos
Jag har en kandidatexamen i bioteknik och en doktorsexamen i kärlbiologi från Dublin City University. Efter postdoktorala tjänster vid Lunds universitet, University of Manchester och Karolinska Institutet etablerade jag min nuvarande forskargrupp vid Karolinska Institutet.
Jag bidrar även till undervisning och kursutveckling vid Karolinska Institutet på grundnivå, avancerad nivå och forskarnivå, med fokus på att integrera beräkningsmässiga och translationella perspektiv i biomedicinsk utbildning.
Lokala ledningsuppdrag och förtroendeuppdrag
Pågående uppdrag
2023 - pågående: Ledamot, Docenturnämnden, KI
2021 - pågående: Ledamot, Institutionsledningsgruppen, OnkPat
2018 - pågående: Ledamot, Arbetsgruppen för lika villkor, OnkPat
Tidigare uppdrag
2021 - 2022: Ledamot, Fakultetsrådet, Karolinska Institutet (representant JF)
2019 - 2022: Vice ordförande, KI Junior Faculty (JF)
Forskningsbeskrivning
Vår forskning fokuserar på cancergenomik och bioinformatik, med särskild inriktning på biomarkörutveckling och patientstratifiering. Ett viktigt forskningsområde är bröstcancer, där vi studerar hur molekylära egenskaper, såsom genexpressionssignaturer och cellcykelaktivitet, påverkar sjukdomsutveckling, behandlingssvar och prognos.
Genom att integrera molekylära data med stora kliniska kohorter identifierar och utvärderar vi biomarkörer med potentiell klinisk relevans. Vi utvecklar även biologiskt förankrade och AI-drivna dataanalytiska metoder för att stödja translationell forskning och förbättra patientstratifiering inom olika cancerformer.
Forskningsledarskap och förtroendeuppdrag
Pågående uppdrag
2021 - pågående: Föreståndare för cBioNet (Cancer Bioinformatics Network), OnkPat
2020 - pågående: Ledamot, Pfizer Breast Cancer Translational Research Advisory Board
2013 - pågående: Ledamot, BRECT (Breast Cancer Research Consortium)
Tidigare uppdrag
2023 - 2025: Ordförande, Cancer Core Europe Summer School
2019 - 2022: Ledamot, styrgruppen för Cancer Research KI (representant för JF)
Undervisning
Jag undervisar huvudsakligen inom bioinformatik på grundnivå, avancerad nivå och forskarnivå vid Karolinska Institutet. Min undervisning fokuserar på hur bioinformatiska metoder kan användas för att öka förståelsen av cancerbiologi. Därutöver föreläser jag om centrala aspekter av cancerbiologi, inklusive cancerns kännetecken (hallmarks of cancer) och den kliniska användningen av genexpressionssignaturer. Jag utbildar även studenter och forskare i etablerade plattformar för cancergenomik, såsom cBioPortal.
Jag är grundutbildningsansvarig (GUA) vid Institutionen för onkologi-patologi, där jag arbetar med utbildningsledning, kursutveckling och strategisk utbildningsplanering. Jag har genomgått 12 veckors högskolepedagogisk utbildning och har omfattande erfarenhet av handledning, examination och mentorskap på grundnivå, avancerad nivå, forskarnivå och postdoktoral nivå.
Utbildningsledarskap och förtroendeuppdrag
Pågående uppdrag
2024–pågående: Ledamot, Education Advisory Board, Gustave Roussy, Paris
2024–pågående: Ledamot, Education and Training Pillar, Cancer Core Europe
2021–pågående: Grundutbildningsansvarig (GUA), OnkPat
2020–pågåend:e Ledamot, FoTO (Forskarutbildning inom cancer), KI
Tidigare uppdrag
2020–2024: Kursansvarig, Molecular Medicine - Oncology, Biomedicinprogrammet, KI
Utvalda publikationer
- Journal article: BMC MEDICINE. 2026;24(1):424Camargo-Romera P; Castresana-Aguirre M; Danielsson O; Dar H; Ostman A; Czene K; Lindstrom LS; Tobin NP
- Article: BREAST CANCER RESEARCH. 2025;28(1):19Computational decoding of cell-cycle phase effects on cancer hallmarks across breast cancer subtypesCastresana-Aguirre M; Matikas A; Lindstrom LS; Tobin NP
- Article: BREAST CANCER RESEARCH. 2024;26(1):38Castresana-Aguirre M; Johansson A; Matikas A; Foukakis T; Lindstroem LS; Tobin NP
- Article: NPJ PRECISION ONCOLOGY. 2022;6(1):59Lundberg A; Yi JJJ; Lindstrom LS; Tobin NP
- Article: ONCOGENE. 2020;39(32):5430-5440Lundberg A; Lindstrom LS; Parker JS; Loverli E; Perou CM; Bergh J; Tobin NP
- Article: BREAST CANCER RESEARCH. 2019;21(1):34Lundberg A; Lindstroem LS; Li J; Harrell JC; Darai-Ramqvist E; Sifakis EG; Foukakis T; Perou CM; Czene K; Bergh J; Tobin NP
- Article: CLINICAL CANCER RESEARCH. 2017;23(24):7512-7520Lundberg A; Lindstrom LS; Harrell JC; Falato C; Carlson JW; Wright PK; Foukakis T; Perou CM; Czene K; Bergh J; Tobin NP
- Article: CLINICAL CANCER RESEARCH. 2017;23(23):7225-7231Tobin NP; Lundberg A; Lindstrom LS; Harrell JC; Foukakis T; Carlsson L; Einbeigi Z; Linderholm BK; Loman N; Malmberg M; Ferno M; Czene K; Perou CM; Bergh J; Hatschek T
- Article: CLINICAL CANCER RESEARCH. 2016;22(10):2417-2426Tobin NP; Wennmalm K; Lindstrom LS; Foukakis T; He L; Genove G; Ostman A; Landberg G; Betsholtz C; Bergh J
- Article: ANNALS OF ONCOLOGY. 2015;26(1):81-88Tobin NP; Harrell JC; Lövrot J; Egyhazi Brage S; Frostvik Stolt M; Carlsson L; Einbeigi Z; Linderholm B; Loman N; Malmberg M; Walz T; Fernö M; Perou CM; Bergh J; Hatschek T; Lindström LS
- Article: BMC CANCER. 2013;13:473Milosevic J; Klinge J; Borg A-L; Foukakis T; Bergh J; Tobin NP
Artiklar
- Article: JNCI-JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 2026;118(7):1248-1256Danielsson O; Dar H; Nordenskjold A; Perez-Tenorio G; Nordenskjold B; Fornander T; Stal O; Tobin NP; Tutzauer J; Johansson A; Lindstrom LS
- Article: INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER. 2026;158(4):1106-1115Danielsson O; Dar H; Perez-Tenorio G; Nordenskjold A; Yau C; Benz CC; Esserman LJ; Nordenskjold B; Stal O; Fornander T; Hartman J; Tobin NP; Johansson A; Lindstrom LS
- Article: ONCOIMMUNOLOGY. 2025;14(1):2481109Tong L; Kremer V; Neo SY; Seitz C; Tobin NP; Seliger B; Harmenberg U; Colon E; Plogell A-HS; Liu LL; Lundqvist A
- Article: JNCI-JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 2025;117(5):868-878Johansson A; Dar H; Nordenskjold A; Perez-Tenorio G; Tobin NP; Yau C; Benz CC; Esserman LJ; van 't Veer LJ; Nordenskjold B; Stal O; Fornander T; Lindstrom LS
- Article: CELL COMMUNICATION AND SIGNALING. 2025;23(1):184Zhang Y; Katkhada K; Meng LZ; Zhao B; Tong S; Chaabane W; Kallai A; Tobin NP; Ostman A; Mega A; Ehnman M
- Article: JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH. 2024;43(1):107Fonseca P; Cui W; Struyf N; Tong L; Chaurasiya A; Casagrande F; Zhao H; Fernando D; Chen X; Tobin NP; Seashore-Ludlow B; Lundqvist A; Hartman J; Gondor A; Ostling P; Holmgren L
- Article: JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY. 2022;40(35):4071-4082Johansson A; Dar H; Veer LJVT; Tobin NP; Perez-Tenorio G; Nordenskjold A; Johansson U; Hartman J; Skoog L; Yau C; Benz CC; Esserman LJ; Stal O; Nordenskjold B; Fornander T; Lindstrom LS
- Article: INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER. 2022;150(12):2072-2082Johansson A; Yu NY; Iftimi A; Tobin NP; 't Veer L; Nordenskjold B; Benz CC; Fornander T; Perez-Tenorio G; Stal O; Esserman LJ; Yau C; Lindstrom LS
- Article: PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY. 2022;18(3):e1010020Jeuken GS; Tobin NP; Kall L
- Article: EUROPEAN JOURNAL OF CANCER. 2022;162:194-205Ugalde-Morales E; Grassmann F; Humphreys K; Li J; Eriksson M; Tobin NP; Lindstrom LS; Vallon-Christersson J; Borg A; Hall P; Czene K
- Article: GENETICS IN MEDICINE. 2022;24(1):157-169Yang M; Johnsson P; Brautigam L; Yang XR; Thrane K; Gao J; Tobin NP; Zhou Y; Yu R; Nagy N; Engstrom PG; Tuominen R; Eriksson H; Lundeberg J; Tucker MA; Goldstein AM; Egyhazi-Brage S; Zhao J; Cao Y; Hoiom V
- Article: CELL REPORTS. 2021;36(8):109616Zhang Y; Zhang Y; Kameishi S; Barutello G; Zheng Y; Tobin NP; Nicosia J; Hennig K; Chiu DK-C; Balland M; Barker TH; Cavallo F; Holmgren L
- Article: CANCERS. 2021;13(5):1175Su Y; Tsagkozis P; Papakonstantinou A; Tobin NP; Gultekin O; Malmerfelt A; Ingelshed K; Neo SY; Lundquist J; Chaabane W; Nisancioglu MH; Leiss LW; Ostman A; Bergh J; Sedimbi S; Lehti K; Lundqvist A; Stragliotto CL; Haglund F; Ehnman M
- Article: INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER. 2021;148(4):884-894Ugalde-Morales E; Grassmann F; Humphreys K; Li J; Eriksson M; Tobin NP; Borg A; Vallon-Christersson J; Hall P; Czene K
- Article: MOLECULAR ONCOLOGY. 2020;14(5):951-963Zerdes I; Sifakis EG; Matikas A; Chretien S; Tobin NP; Hartman J; Rassidakis GZ; Bergh J; Foukakis T
- Article: JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION. 2020;130(3):1185-1198Neo SY; Yang Y; Record J; Ma R; Chen X; Chen Z; Tobin NP; Blake E; Seitz C; Thomas R; Wagner AK; Andersson J; de Boniface J; Bergh J; Murray S; Alici E; Childs R; Johansson M; Westerberg LS; Haglund F; Hartman J; Lundqvist A
- Article: GLIA. 2020;68(2):316-327Mega A; Nilsen MH; Leiss LW; Tobin NP; Miletic H; Sleire L; Strell C; Nelander S; Krona C; Hagerstrand D; Enger PO; Nister M; Ostman A
- Article: CANCERS. 2019;11(10):E1479-1479Zerdes I; Wallerius M; Sifakis EG; Wallmann T; Betts S; Bartish M; Tsesmetzis N; Tobin NP; Coucoravas C; Bergh J; Rassidakis GZ; Rolny C; Foukakis T
- Article: EBIOMEDICINE. 2019;48:212-223Svedlund J; Strell C; Qian X; Zilkens KJC; Tobin NP; Bergh J; Sieuwerts AM; Nilsson M
- Article: JAMA ONCOLOGY. 2019;5(9):1304-1309Yu NY; Iftimi A; Yau C; Tobin NP; van 't Veer L; Hoadley KA; Benz CC; Nordenskjold B; Fornander T; Stal O; Czene K; Esserman LJ; Lindstrom LS
- Visa fler
Alla övriga publikationer
- Preprint: MEDRXIV. 2026Camargo-Romera P; Castresana-Aguirre M; Danielsson O; Dar H; Östman A; Czene K; Lindström LS; Tobin N
- Preprint: BIORXIV. 2025Castresana-Aguirre M; Matikas A; Lindström L; Tobin N
- Poster: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s327Romera PC; Romero MR; Danielsson O; Dar HA; Lindstrom LS; Tobin NP
- Poster: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s346Danielsson O; Dar HA; Nordenskjold A; Tenorio GP; Yau C; Benz C; Van't Veer LJ; Esserman L; Nordenskjold BA; Fornander T; Stal O; Tobin NP; Johansson A; Lindstrom LS
- Poster: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s346Romero MR; Danielsson O; Fornander T; Nordenskjold A; Tenorio GP; Tobin NP; Nordenskjold BA; Stal O; Esserman L; Van't Veer LJ; Lindstrom LS
- Poster: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s340Tutzauer J; De Vos JKJ; Nordenskjold A; Nordenskjold BA; Fornander T; Tenorio GP; Stal O; Tobin NP; Lindstrom LS
- Poster: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s390De Vos JKJ; Tutzauer J; Nordenskjold A; Nordenskjold BA; Fornander T; Tenorio GP; Stal O; Tobin NP; Lindstrom LS
- Letter: CANCER COMMUNICATIONS. 2023;43(7):855-859Tong L; Kremer V; Neo SY; Liu Y; Chen Y; Wagner AK; Yang Y; Chen Z; Seitz C; Tobin NP; Ligtenberg MA; Alici E; Chen X; Haglund F; Seliger B; Harmenberg U; Colon E; Plogell A-HS; Liu LL; Lundqvist A
- Poster: CANCER RESEARCH. 2023;83(5):p6-01-08-p6-01-08Aguirre MC; Johansson A; Lindstrom LS; Tobin N
- Preprint: MEDRXIV. 2023Castresana-Aguirre M; Johansson A; Matikas A; Foukakis T; Lindström L; Tobin N
- Conference publication: CLINICAL CANCER RESEARCH. 2022;28(18)Ehnman M; Katkhada K; Meng LZ; Zhang Y; Zhao B; Tong S; Kallai A; Ostman A; Tobin N
- Poster: CLINICAL CANCER RESEARCH. 2022;28(18_Supplement):a039Ehnman M; Katkhada K; Meng LZ; Zhang Y; Zhao B; Tong S; Kallai A; Östman A; Tobin N
- Preprint: BIORXIV. 2022Lundberg A; Yi JJJ; Lindström L; Tobin N
- Preprint: BIORXIV. 2021Jeuken GS; Tobin NP; Käll L
- Preprint: BIORXIV. 2021Zhang Y; Zhang Y; Kameishi S; Barutello G; Zheng Y; Tobin N; Nicosia J; Hennig K; Chiu DK-C; Balland M; Barker T; Cavallo F; Holmgren L
- Preprint: RESEARCH SQUARE. 2020Johansson A; Yu NY-L; Iftimi A; Tobin NP; Veer LV; Nordenskjöld B; Benz CC; Fornander T; Perez-Tenorio G; Stål O; Esserman L; Yau C; Lindström LS
- Preprint: BIORXIV. 2020Lundberg A; Lindström LS; Parker JS; Löverli E; Perou CM; Bergh J; Tobin NP
- Poster: JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY. 2019;37(15):550Zerdes I; Sifakis EG; Tobin N; Bergh JCS; Matikas A; Foukakis T
- Poster: CANCER RESEARCH. 2019;79(4):p2-08-25-p2-08-25Zerdes I; Sifakis E; Matikas A; Tobin NP; Charlotte R; Rassidakis GZ; Bergh J; Foukakis T
- Conference publication: NEURO-ONCOLOGY. 2018;20:263-264Mega A; Leiss L; Nilsen MH; Tobin N; Sleire L; Strell C; Liu J; Nekhotiaeva N; Eriksson A; Nelander S; Uhrbom L; Krona C; Hagerstrand D; Enger PO; Nister M; Ostman A
- Visa fler
Anställningar
- Senior Forskare, Onkologi-Patologi, Karolinska Institutet, 2022-
- Adjunkt, Onkologi-Patologi, Karolinska Institutet, 2021-
Examina och utbildning
- Docent, Bioinformatik, Karolinska Institutet, 2018