Nicholas Tobin
Om mig
Jag är senior forskare och forskargruppsledare vid Karolinska Institutet med fokus på cancergenomik, beräkningsbiologi och translationell cancerforskning. Min forskning syftar till att utveckla biomarkörer för förbättrad patientstratifiering inom cancer genom att integrera molekylära och kliniska data för att förstå sjukdomsutveckling, behandlingssvar och långtidsprognos
Jag har en kandidatexamen i bioteknik och en doktorsexamen i kärlbiologi från Dublin City University. Efter postdoktorala tjänster vid Lunds universitet, University of Manchester och Karolinska Institutet etablerade jag min nuvarande forskargrupp vid Karolinska Institutet.
Jag bidrar även till undervisning och kursutveckling vid Karolinska Institutet på grundnivå, avancerad nivå och forskarnivå, med fokus på att integrera beräkningsmässiga och translationella perspektiv i biomedicinsk utbildning.
Lokala ledningsuppdrag och förtroendeuppdrag
Pågående uppdrag
2023 - pågående: Ledamot, Docenturnämnden, KI
2021 - pågående: Ledamot, Institutionsledningsgruppen, OnkPat
2018 - pågående: Ledamot, Arbetsgruppen för lika villkor, OnkPat
Tidigare uppdrag
2021 - 2022: Ledamot, Fakultetsrådet, Karolinska Institutet (representant JF)
2019 - 2022: Vice ordförande, KI Junior Faculty (JF)
Forskningsbeskrivning
Vår forskning fokuserar på cancergenomik och bioinformatik, med särskild inriktning på biomarkörutveckling och patientstratifiering. Ett viktigt forskningsområde är bröstcancer, där vi studerar hur molekylära egenskaper, såsom genexpressionssignaturer och cellcykelaktivitet, påverkar sjukdomsutveckling, behandlingssvar och prognos.
Genom att integrera molekylära data med stora kliniska kohorter identifierar och utvärderar vi biomarkörer med potentiell klinisk relevans. Vi utvecklar även biologiskt förankrade och AI-drivna dataanalytiska metoder för att stödja translationell forskning och förbättra patientstratifiering inom olika cancerformer.
Forskningsledarskap och förtroendeuppdrag
Pågående uppdrag
2021 - pågående: Föreståndare för cBioNet (Cancer Bioinformatics Network), OnkPat
2020 - pågående: Ledamot, Pfizer Breast Cancer Translational Research Advisory Board
2013 - pågående: Ledamot, BRECT (Breast Cancer Research Consortium)
Tidigare uppdrag
2023 - 2025: Ordförande, Cancer Core Europe Summer School
2019 - 2022: Ledamot, styrgruppen för Cancer Research KI (representant för JF)
Undervisning
Jag undervisar huvudsakligen inom bioinformatik på grundnivå, avancerad nivå och forskarnivå vid Karolinska Institutet. Min undervisning fokuserar på hur bioinformatiska metoder kan användas för att öka förståelsen av cancerbiologi. Därutöver föreläser jag om centrala aspekter av cancerbiologi, inklusive cancerns kännetecken (hallmarks of cancer) och den kliniska användningen av genexpressionssignaturer. Jag utbildar även studenter och forskare i etablerade plattformar för cancergenomik, såsom cBioPortal.
Jag är grundutbildningsansvarig (GUA) vid Institutionen för onkologi-patologi, där jag arbetar med utbildningsledning, kursutveckling och strategisk utbildningsplanering. Jag har genomgått 12 veckors högskolepedagogisk utbildning och har omfattande erfarenhet av handledning, examination och mentorskap på grundnivå, avancerad nivå, forskarnivå och postdoktoral nivå.
Utbildningsledarskap och förtroendeuppdrag
Pågående uppdrag
2024–pågående: Ledamot, Education Advisory Board, Gustave Roussy, Paris
2024–pågående: Ledamot, Education and Training Pillar, Cancer Core Europe
2021–pågående: Grundutbildningsansvarig (GUA), OnkPat
2020–pågåend:e Ledamot, FoTO (Forskarutbildning inom cancer), KI
Tidigare uppdrag
2020–2024: Kursansvarig, Molecular Medicine - Oncology, Biomedicinprogrammet, KI
Artiklar
- Article: JNCI-JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 2026;118(7):1248-1256Danielsson O; Dar H; Nordenskjold A; Perez-Tenorio G; Nordenskjold B; Fornander T; Stal O; Tobin NP; Tutzauer J; Johansson A; Lindstrom LS
- Article: INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER. 2026;158(4):1106-1115Danielsson O; Dar H; Perez-Tenorio G; Nordenskjold A; Yau C; Benz CC; Esserman LJ; Nordenskjold B; Stal O; Fornander T; Hartman J; Tobin NP; Johansson A; Lindstrom LS
- Article: ONCOIMMUNOLOGY. 2025;14(1):2481109Tong L; Kremer V; Neo SY; Seitz C; Tobin NP; Seliger B; Harmenberg U; Colon E; Plogell A-HS; Liu LL; Lundqvist A
- Article: BREAST CANCER RESEARCH. 2025;28(1):19Computational decoding of cell-cycle phase effects on cancer hallmarks across breast cancer subtypesCastresana-Aguirre M; Matikas A; Lindstrom LS; Tobin NP
- Article: JNCI-JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 2025;117(5):868-878Johansson A; Dar H; Nordenskjold A; Perez-Tenorio G; Tobin NP; Yau C; Benz CC; Esserman LJ; van 't Veer LJ; Nordenskjold B; Stal O; Fornander T; Lindstrom LS
- Article: CELL COMMUNICATION AND SIGNALING. 2025;23(1):184Zhang Y; Katkhada K; Meng LZ; Zhao B; Tong S; Chaabane W; Kallai A; Tobin NP; Ostman A; Mega A; Ehnman M
- Journal article: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s327Romera PC; Romero MR; Danielsson O; Dar HA; Lindstrom LS; Tobin NP
- Journal article: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s346Danielsson O; Dar HA; Nordenskjold A; Tenorio GP; Yau C; Benz C; Van't Veer LJ; Esserman L; Nordenskjold BA; Fornander T; Stal O; Tobin NP; Johansson A; Lindstrom LS
- Journal article: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s346Romero MR; Danielsson O; Fornander T; Nordenskjold A; Tenorio GP; Tobin NP; Nordenskjold BA; Stal O; Esserman L; Van't Veer LJ; Lindstrom LS
- Journal article: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s340Tutzauer J; De Vos JKJ; Nordenskjold A; Nordenskjold BA; Fornander T; Tenorio GP; Stal O; Tobin NP; Lindstrom LS
- Journal article: ANNALS OF ONCOLOGY. 2024;35:s390De Vos JKJ; Tutzauer J; Nordenskjold A; Nordenskjold BA; Fornander T; Tenorio GP; Stal O; Tobin NP; Lindstrom LS
- Article: JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH. 2024;43(1):107Fonseca P; Cui W; Struyf N; Tong L; Chaurasiya A; Casagrande F; Zhao H; Fernando D; Chen X; Tobin NP; Seashore-Ludlow B; Lundqvist A; Hartman J; Gondor A; Ostling P; Holmgren L
- Article: BREAST CANCER RESEARCH. 2024;26(1):38Castresana-Aguirre M; Johansson A; Matikas A; Foukakis T; Lindstroem LS; Tobin NP
- Journal article: CANCER RESEARCH. 2023;83(5):p6-01-08-p6-01-08Aguirre MC; Johansson A; Lindstrom LS; Tobin N
- Article: JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY. 2022;40(35):4071-4082Johansson A; Dar H; Veer LJVT; Tobin NP; Perez-Tenorio G; Nordenskjold A; Johansson U; Hartman J; Skoog L; Yau C; Benz CC; Esserman LJ; Stal O; Nordenskjold B; Fornander T; Lindstrom LS
- Journal article: CLINICAL CANCER RESEARCH. 2022;28(18_Supplement):a039Ehnman M; Katkhada K; Meng LZ; Zhang Y; Zhao B; Tong S; Kallai A; Östman A; Tobin N
- Article: NPJ PRECISION ONCOLOGY. 2022;6(1):59Lundberg A; Yi JJJ; Lindstrom LS; Tobin NP
- Article: INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER. 2022;150(12):2072-2082Johansson A; Yu NY; Iftimi A; Tobin NP; 't Veer L; Nordenskjold B; Benz CC; Fornander T; Perez-Tenorio G; Stal O; Esserman LJ; Yau C; Lindstrom LS
- Article: PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY. 2022;18(3):e1010020Jeuken GS; Tobin NP; Kall L
- Article: EUROPEAN JOURNAL OF CANCER. 2022;162:194-205Ugalde-Morales E; Grassmann F; Humphreys K; Li J; Eriksson M; Tobin NP; Lindstrom LS; Vallon-Christersson J; Borg A; Hall P; Czene K
- Visa fler
Alla övriga publikationer
- Preprint: MEDRXIV. 2026Camargo-Romera P; Castresana-Aguirre M; Danielsson O; Dar H; Östman A; Czene K; Lindström LS; Tobin N
- Preprint: BIORXIV. 2025Castresana-Aguirre M; Matikas A; Lindström L; Tobin N
- Letter: CANCER COMMUNICATIONS. 2023;43(7):855-859Tong L; Kremer V; Neo SY; Liu Y; Chen Y; Wagner AK; Yang Y; Chen Z; Seitz C; Tobin NP; Ligtenberg MA; Alici E; Chen X; Haglund F; Seliger B; Harmenberg U; Colon E; Plogell A-HS; Liu LL; Lundqvist A
- Preprint: MEDRXIV. 2023Castresana-Aguirre M; Johansson A; Matikas A; Foukakis T; Lindström L; Tobin N
- Conference publication: CLINICAL CANCER RESEARCH. 2022;28(18)Ehnman M; Katkhada K; Meng LZ; Zhang Y; Zhao B; Tong S; Kallai A; Ostman A; Tobin N
- Preprint: BIORXIV. 2022Lundberg A; Yi JJJ; Lindström L; Tobin N
- Preprint: BIORXIV. 2021Jeuken GS; Tobin NP; Käll L
- Preprint: BIORXIV. 2021Zhang Y; Zhang Y; Kameishi S; Barutello G; Zheng Y; Tobin N; Nicosia J; Hennig K; Chiu DK-C; Balland M; Barker T; Cavallo F; Holmgren L
- Preprint: RESEARCH SQUARE. 2020Johansson A; Yu NY-L; Iftimi A; Tobin NP; Veer LV; Nordenskjöld B; Benz CC; Fornander T; Perez-Tenorio G; Stål O; Esserman L; Yau C; Lindström LS
- Preprint: BIORXIV. 2020Lundberg A; Lindström LS; Parker JS; Löverli E; Perou CM; Bergh J; Tobin NP
- Meeting abstract: JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY. 2019;37(15):550Zerdes I; Sifakis EG; Tobin N; Bergh JCS; Matikas A; Foukakis T
- Meeting abstract: CANCER RESEARCH. 2019;79(4):p2-08-25-p2-08-25Zerdes I; Sifakis E; Matikas A; Tobin NP; Charlotte R; Rassidakis GZ; Bergh J; Foukakis T
- Conference publication: NEURO-ONCOLOGY. 2018;20:263-264Mega A; Leiss L; Nilsen MH; Tobin N; Sleire L; Strell C; Liu J; Nekhotiaeva N; Eriksson A; Nelander S; Uhrbom L; Krona C; Hagerstrand D; Enger PO; Nister M; Ostman A
- Conference publication: CANCER RESEARCH. 2017;77:p2-03-03-p2-03-03Czene K; Ivansson E; Klevebring D; Tobin NP; Lindstrom LS; Holm J; Prochazka G; Hilliges C; Palmgren J; Tornberg S; Humphreys K; Hartman J; Frisell J; Rantalainen M; Lindberg J; Hall P; Bergh J; Gronberg H; Li J
- Conference publication: CANCER RESEARCH. 2017;77:p1-07-07-p1-07-07Lundberg A; Lindstrom LS; Falato C; Carlson JW; Foukakis T; Czene K; Bergh J; Tobin NP
- Conference publication: CANCER RESEARCH. 2017;77:p1-07-16-p1-07-16Tobin NP; Lundberg A; Lindstrom LS; Harrell JC; Brage SE; Stolt MF; Einbeigi Z; Loman N; Malmberg M; Perou CM; Bergh J; Hatschek T
- Corrigendum: CANCER RESEARCH. 2016;76(20):6131-6132Cunha SI; Bocci M; Lovrot J; Eleftheriou N; Roswall P; Cordero E; Falato C; Tobin NP; Lorent J; Lindstrom LS; Bergh J; Foukakis T
- Conference publication: EUROPEAN JOURNAL OF CANCER. 2016;57:S130Kjallquist U; Erlandsson R; Hartman J; Alkodsi A; Tobin N; Hatschek T; Bergh J; Linnarsson S
- Corrigendum: JNCI-JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 2016;108(3):djv434
- Conference publication: CANCER RESEARCH. 2016;76Esserman LJ; Thompson CK; Yau C; van't Veer LJ; Borowsky AD; Tobin NP; Nordenskjold B; Fornander T; Stal O; Benz CC; Lindstrom LS
- Visa fler
Anställningar
- Senior Forskare, Onkologi-Patologi, Karolinska Institutet, 2022-
- Adjunkt, Onkologi-Patologi, Karolinska Institutet, 2021-
Examina och utbildning
- Docent, Bioinformatik, Karolinska Institutet, 2018