Shayan Mostafaei

Om mig

Översikt

Jag är bioinformatiker vid Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik, Karolinska Institutet, med en doktorsexamen i biostatistik och bioinformatik samt postdoktoral utbildning inom maskininlärning, artificiell intelligens och demensforskning.

Min forskning ligger i gränslandet mellan bioinformatik, biostatistik, statistisk genetik, multi-omik, artificiell intelligens och molekylär epidemiologi. Jag utvecklar och tillämpar avancerade statistiska och beräkningsbaserade metoder på storskaliga populationskohorter, hälsoregister och högdimensionella molekylära data för att bättre förstå biologiskt åldrande, demens, åldersrelaterade sjukdomar och individuell variation i sjukdomsrisk.

Ett centralt fokus i min forskning är integrering av genetiska, epigenetiska, proteomiska, metabolomiska, kliniska och longitudinella data med hjälp av maskininlärning och statistisk modellering. Mina metodologiska intressen omfattar djupinlärning, generativa metoder och representationsinlärning, statistisk inlärning för omikdata, polygen riskprediktion, Bayesiansk modellering, kausal inferens, överlevnadsanalys, longitudinell modellering samt tolkbar riskprediktion.

Min senaste forskning omfattar AI-baserad polygen riskprediktion för Alzheimers sjukdom och relaterade demenssjukdomar, biologiskt och epigenetiskt åldrande, multi-omikbaserade signaturer för biologiskt åldrande samt maskininlärningsmetoder för högdimensionella longitudinella och epidemiologiska data. Jag är särskilt intresserad av att utveckla reproducerbara och kliniskt relevanta beräkningsmetoder som knyter samman molekylära data, populationshälsa och precisionsmedicin.

Utbildning

• Doktorsexamen i biostatistik och bioinformatik, Tehran University of Medical Sciences, Teheran, Iran, 2018.

Postdoktoral utbildning

• Postdoktoral forskare inom maskininlärning och artificiell intelligens, School of Electrical Engineering and Computer Science, Department of Intelligent Systems, Division of Information Science and Engineering, KTH Royal Institute of Technology, Stockholm, 2022.
• Postdoktoral forskare inom demens och maskininlärning, Division of Clinical Geriatrics, Department of Neurobiology, Care Sciences and Society, Karolinska Institutet, Stockholm, 2023.

• Artificiell intelligens och maskininlärning inom biomedicin
• Generativa metoder och representationsinlärning
• Statistisk inlärning för multi-omikdata
• Bioinformatik och statistisk genetik
• Multi-omikintegration
• Biologiskt åldrande och åldrandeklockor
• Demens samt Alzheimers sjukdom och relaterade demenssjukdomar
• Polygen riskprediktion och genetisk riskmodellering
• GWAS och EWAS
• Överlevnadsanalys, longitudinell modellering och riskmodellering
• Bayesiansk modellering och kausal inferens
• Precisionsmedicin och individanpassad riskprediktion
• Analys av storskaliga populations- och registerdata
• Högdimensionella biomedicinska data