Rozbeh Jafari

Vi använder och kombinerar omikmetoder för att få en mer detaljerad bild av den molekylära fenotypen hos akut lymfatisk leukemi (ALL) hos barn och vuxna, med målet att identifiera precisions medicin kandidater för förbättrad behandling. Genom att bygga på våra senaste studier (Leo, I.R. et al., Nat Commun 13, 1691 (2022), PMID:35354797, Kurzawa, N. et al., Nat Chem Biol 19, 962–971 (2023), PMID:36941476), avancerar vi projekten och valideringen av precisions medicin kandidaterna, med starkt fokus på deras translationella implementering.

En grundläggande fråga vi för närvarande adresserar är hur avvikelser i genomet påverkar det funktionella proteomet genom att kombinera genomik med proteomikdata. Detta område är känt som cancer proteogenomik. Utöver kvantitativ proteomik lägger vi till ytterligare ett lager av information genom att fånga proteomets biofysiskaliska tillstånd med hjälp av termisk proteomik. Denna metod gör det även möjligt för oss att identifiera funktionella proteoformer samt deras koppling till läkemedelskänslighet.

Vidare undersöker vi även måltavlorna för godkända och nya målinriktade behandlingar med hjälp av ortogonala kemiska proteomikmetoder för att förstå deras verkningsmekanismer samt deras potentiella toxicitet. Vår forskning fokuserar också på molekylär och cellulär biologi, med målet att översätta våra fynd till kliniska tillämpningar som kan förbättra behandlingsmöjligheterna för patienter.