Rongrong Fan

Fan Laboratory of Molecular Endocrinology (www.fanlab-ki.com) verkar i skärningspunkten mellan klinisk fenotypning och funktionell genomik. Vår målsättning är att dechiffrera den epigenetiska programmeringen bakom metabol hälsa och sjukdom. Vi strävar efter att förstå hur miljöfaktorer och nutritionella signaler fysiskt omformar kromatinlandskapet och därigenom driver utvecklingen av metabola sjukdomar såsom typ 2-diabetes (T2D), fettleversjukdom (MASLD) och hjärt-kärlsjukdomar (CVD).

Vår forskning tillämpar en "bench-to-bedside"-strategi, där vi integrerar multi-omics-data från patientkohorter med precis molekylärbiologi för att lösa två stora utmaningar inom metabol medicin:

1. Kartläggning av kretslopp för transkriptionsfaktorer och coregulatorer: Vi fokuserar på hur transkriptionsfaktorer och coregulatorer fungerar som molekylära strömbrytare i metabola vävnader. Vår forskning har visat att dysreglering av centrala coregulatorer (såsom GPS2) utlöser en "dubbelstöt" av systemisk inflammation och störd lipid- och kolesterolmetabolism, vilket accelererar progressionen av typ 2-diabetes, MASLD och hjärt-kärlsjukdomar.
2. Avkodning av funktionella epigenetiska koder: Min forskning utforskar genomets "mörka materia" – de distala enhancers och silencers som orkestrerar vävnadsspecifika responser. Vi strävar efter att avkoda den specifika epigenetiska grammatik som gör det möjligt för näringssignaler att skifta distala enhancers från ett latent till ett aktivt stadium, eller omvänt, hur metabol stress rekryterar silencers för att stänga ner skyddande metabola signalvägar. Genom att kartlägga och förstå dessa distala regulatoriska element blottlägger vi ett dolt lager i genomet som dikterar hur en individs lever svarar på metabol belastning.

Metodologi

Vi använder en sofistikerad "Multi-OMICs"-verktygslåda för att överbrygga gapet mellan genotyp och fenotyp:

• Transkriptomik & Cistromik: Kartläggning av regulatoriska nätverk i lever och fettvävnad.
• Avancerad epigenetik: Användning av ultrakänslig ChIP-seq och "padlock probe"-teknologi för detektion av cellfritt DNA (cfDNA) i låga koncentrationer.
• Klinisk integration: Aktivt samarbete med kliniska biobanker (t.ex. KaLiB) vid Campus Flemingsberg/Karolinska Universitetssjukhuset för att säkerställa att våra molekylära fynd har direkt relevans för patientpopulationen i Region Stockholm.

Vi tackar tacksammast för det generösa forskningsstöd till våra pågående projekt som erhållits från Vetenskapsrådet, Cancerfonden, Novo Nordisk Fonden, European Foundation for the Study of Diabetes, SRP Diabetes samt många andra anslagsgivare.

• Huvudhandledare för 4 pågående doktorander och 1 postdoktor.
• Bihandledare för 1 pågående doktorand och 2 disputerade doktorander.
• Suttit i betygsnämnd, varit opponent eller deltagit vid halvtidsseminarier för fler än 20 doktorander.
• Handledare för 5 kandidatstudenter och 2 masterstudenter.
• Omfattande undervisningserfarenhet med över 200 timmar på kandidat-, master- och forskarnivå.
• Kursansvarig (Course Director) på masternivå.
• Högskolepedagogisk utbildning.