Roberto Ballarino

Jag är postdoktor vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi på Karolinska Institutet. Min forskning fokuserar på transkriptionella och epigenetiska mekanismer som styr hjärnans utveckling och funktion i hälsa och sjukdom, med ett särskilt intresse för cellödesbestämning och de dynamiska beslut som fattas av stamceller.

Jag är uppvuxen i Nederländerna och avlade en kandidatexamen i biomedicinska vetenskaper vid Utrecht University (2011–2015) samt en masterexamen i neurovetenskap vid Erasmus University Rotterdam (2015–2017). Därefter genomförde jag doktorandstudier i medicinsk vetenskap vid SciLifeLab (2017–2023) under handledning av Nicola Crosetto och Magda Bienko vid Institutionen för medicinsk biokemi och biofysik, där jag studerade hjärnans molekylära mosaicism samt DNA-skadors och 3D-genomorganisationens roll i stamcellers ödesbestämning och transkriptionsreglering. År 2024 anslöt jag till Rickard Sandbergs forskargrupp vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi för att studera hjärnans splitsningskoder. Min postdoktorala forskning undersöker hur alternativ splitsning bidrar till funktionell diversifiering av neuroner under hjärnans utveckling genom att kombinera högautomatiserad singelcellgenomik, storskaliga utvecklingsdataset samt pågående bidrag inom NIH BRAIN Initiative Cell Atlas Network (BICAN). För närvarande utvidgar jag detta arbete genom att analysera transkriptionell dynamik med singelcellsupplösning för att definiera vad som gör neuronala populationer unika.

År 2026 tilldelades jag Mats Sundin Fellowship in Human Developmental Health, ett mycket konkurrensutsatt tvåårigt utbytesstipendium i samarbete med University of Toronto som stödjer forskning om tidiga livsfaktorers betydelse för hälsa. Jag kommer att ansluta till Donnelly Centre (University of Toronto) för att bedriva ett maskininlärningsprojekt. Projektet fokuserar på att integrera singelcellsdata för att identifiera övergående celltillstånd med betydelse för neurodevelopmentella sjukdomar.

Min forskning fokuserar på att klarlägga den komplexa rollen som alternativ splitsning spelar i diversifieringen av neuronala populationer och dess påverkan på synaptisk konnektivitet i hjärnan. Projektet syftar specifikt till att förstå hur alternativ splitsning bidrar till finjustering av neuronal utveckling, etablering av synaptiska nätverk och den övergripande funktionen hos centrala nervsystemet. För att uppnå detta använder jag avancerade singelcellsekvenseringsteknologier, såsom Smart-seq3xpress, Parse Evercode och Takaras Shasta Total RNA, i kombination med sofistikerade deep learning-modeller för att analysera de molekylära mekanismer som driver dessa processer i stor skala.