Karthik Vijay Nair
Doktorand
E-postadress: karthik.nair@ki.se
Besöksadress: BioMedicum A4, Solnavägen 9, 17165 Solna
Postadress: K6 Kvinnors och barns hälsa, K6 NOGRH Gemzell Danielsson Alkasalias, 171 77 Stockholm
Om mig
Doktorand som använder bioinformatik för att förbättra kvinnors reproduktiva hälsa.
Jag använder R, Python, bash och andra verktyg vid behov för att analysera data och få fram insikter. Jag använder AI för kodning men sköter dokumentationen manuellt.
För närvarande utforskar jag NGS-landskapet i odlingsmedium från embryon. Jag arbetar även med spatial transkriptomik för att förstå hur endometrios påverkar äggstockscancer.
Forskningsbeskrivning
Arbetar för närvarande med transkriptomiska data från SmartSeq3, SmallSeq, GeoMx och Visium HD.
Har mer än tre års erfarenhet av att identifiera orsakande varianter vid sällsynta genetiska sjukdomar genom genomiska bioinformatisk analys, med stöd av fenotypmatchning samt databearbetning och -analys.
Artiklar
- Journal article: AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A. 2026Badiger VA; Radhakrishnan P; Balan S; Rao AP; Udupa P; Nair KV; Hunakunti B; Prasannakumar AP; Limaye S; Shaikh HG; Naik R; Janarthanan M; Sridharan S; Sondhi V; Nampoothiri S; Shah H; Mahadevan S; Mamadapur M; Pandya D; Girisha KM; Shivpuri A; Moirangthem A; Raghuram J; Bhavani GSL; Jeevanagi S; Subramaniam G; Aggarwal A; Shukla A; Narayanan DL
- Journal article: HUMAN REPRODUCTION. 2026;41:deag083.073Frisendahl C; Gemzell-Danielsson K; Nair K; Koch F; Menezes J; Sheikhi M; Dahlgren K; Alnahal W; Bohlin T; Olofsson JI; Tohonen V; Vafaee F; Grace LP; Boggavarapu NR; Faridani OR
- Journal article: EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. 2025;33(11):1451-1461Kandettu A; Yeole M; Sekar H; Garapati K; Kaur N; Anand A; Hegde P; Nair K; Medishetti R; Bhat V; Radhakrishnan P; Mundkur SC; Shrikiran HA; Pandey A; Sevilimedu A; Chakrabarty S; Shukla A
- Journal article: HUMAN REPRODUCTION. 2025;40:deaf097.085Tang Y; Frisendahl C; Nair K; Rao Boggavarapu N; Flam F; Kopp Kallner H; Papaikonomou K; Lalitkumar PG; Gemzell-Danielsson K
- Article: EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. 2024;32(10):1291-1298Pande S; Majethia P; Nair K; Rao LP; Mascarenhas S; Kaur N; do Rosario MC; Neethukrishna K; Chaurasia A; Hunakunti B; Jadhav N; Xavier S; Kumar J; Bhat V; Bhavani GS; Narayanan DL; Yatheesha BL; Patil SJ; Nampoothiri S; Kamath N; Aroor S; Bhat RY; Lewis LE; Sharma S; Bajaj S; Sankhyan N; Siddiqui S; Nayak SS; Bielas S; Girisha KM; Shukla A
- Journal article: CLINICAL GENETICS. 2024;105(6):639-654Majethia P; Kaur N; Mascarenhas S; Rao LP; Pande S; Narayanan DL; Bhat V; Nayak SS; Nair KV; Prasannakumar AP; Chaurasia A; Hunakunti B; Jadhav N; Farooqui S; Yeole M; Kothiwale V; Naik R; Bhat V; Aroor S; Lewis L; Purkayastha J; Bhat YR; Praveen BK; Yatheesha BL; Patil SJ; Nampoothiri S; Kamath N; Siddiqui S; Bielas S; Girisha KM; Sharma S; Shukla A
- Journal article: CLINICAL GENETICS. 2024;105(3):302-307Jairaman A; Badiger VA; Raj S; Nair KV; Balan S; Narayanan DL
- Journal article: CLINICAL DYSMORPHOLOGY. 2023;32(4):162-167Mishra S; Nair KV; Shukla A
- Journal article: INDIAN JOURNAL OF PEDIATRICS. 2022;89(6):594-596Mohite K; Nair KV; Sapare A; Bhat V; Shukla A; Kekatpure M; Patil SJ
- Article: CLINICAL GENETICS. 2021;100(5):542-550Kaur P; do Rosario MC; Hebbar M; Sharma S; Kausthubham N; Nair K; Shrikiran A; Bhat YR; Lewis LES; Nampoothiri S; Patil SJ; Suresh N; Bijarnia Mahay S; Dua Puri R; Pai S; Kaur A; Rakshith KC; Kamath N; Bajaj S; Kumble A; Shetty R; Shenoy R; Kamate M; Shah H; Muranjan MN; Yatheesha BL; Avabratha KS; Subramaniam G; Kadavigere R; Bielas S; Girisha KM; Shukla A
Alla övriga publikationer
- Preprint: BIORXIV. 2025Frisendahl C; Gemzell-Danielsson K; Nair K; Koch F; Menezes J; Sheikhi M; Dahlgren K; Alnahal W; Lindgren K; Bohlin T; Olofsson JI; Töhönen V; Vafaee F; Lalitkumar PG; Boggavarapu NR; Faridani OR