Ghada Nouairia

Primary sclerosing cholangitis (PSC) presents several distinct symptom presentations defining different PSC subtypes, based on the presence or absence of inflammatory bowel disease (IBD), the presence of cancer, and the disease aggressivity. Importantly, individuals with PSC might benefit from different therapeutic and surveillance strategies. However, the biological understanding of these various phenotypes of PSC is poor. Although the disease is manifested in the liver and the biliary tract, PSC has a global impact on the body. Every minute, a liter of blood is passing the liver, where the latter releases fingerprints from its damaged tissues. Therefore, we hypothesize that a large-scale characterization of the blood can reveal biological differences of the PSC subtypes. In this pilot study, we propose a large-scale quantification of the proteins, metabolites, gene expression sequences and autoantibodies that are present in the blood of 36 people affected by PSC and healthy donors. We then plan to use machine learning methods to find biomarkers that are informative about (1) the prognosis of the disease and (2) the PSC subtype, namely PSC with and without IBD, PSC progressing faster toward end stage liver disease, and PSC with cancer. These biomarkers are blood based and can be implemented in a simple, non-invasive clinical test as a surveillance tool for monitoring PSC progression. The project provides a complete description of the PSC subtypes on several biological levels (autoantibodies, gene expression, proteins, and metabolites), setting the foundation to (1) find new targets for therapy, encouraging pharmacological investment in PSC treatment and (2) adapt PSC health care plan to the individual needs.

Gallgångscancer (CCA) och gallblåserscancer (GBC) är mycket aggressiva former av cancer som är vanligtvis mycket sent upptäkt och har dålig prognos. Förhöjd risk för CCA och GBC är mestadels oförklarlig och studier som förklara riskfaktorerna behövs. Primär skleroserande kolangit (PSC) är en kronisk progressiv leversjukdom med hög risk för gallgångsrelaterad cancer (15-20%). PSC har ingen känd behandling som kan bromsar sjukdomsutveckling eller minskar cancerrisk. PSC patienter kan fungera som en modell för att studera populationer med hög risk för CCA och GBC. Markörer för tidig cancerutveckling och prognos saknas för de här sjukdomar. Den här forskningsprogrammet söker nya markörer för tidig cancerdiagnostik och sjukdomrogress hos patienter med hög risk för CCA och GBC och för att hjälpa till vid beslutsfattandet om kirurgiskt avlägsnande av tumören. Den identifierar också biologiska mekanismer som påverkas gallgångs sjukdomar.