Tahmina Akhter

Tahmina Akhter

Systemutvecklare
E-postadress: tahmina.akhter@ki.se
Telefon: +46852487817
Besöksadress: Nobels väg 12a, 17165 Solna
Postadress: C8 Medicinsk epidemiologi och biostatistik, C8 Administration IT, 171 77 Stockholm
Del av:

Om mig

  • Jag är en erfaren bioinformatiker med en doktorsexamen i beräkningsbiologi, med fokus på att integrera omicsdata och statistiska modeller för att lösa komplexa biologiska problem. För närvarande arbetar jag som systemutvecklare vid Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik på Karolinska Institutet. Min roll innefattar att bearbeta och hantera storskaliga kliniska, register- och hälsodata, implementera avancerade statistiska modeller och automatisera arbetsflöden för att effektivisera forskningsprocesser.

    Min expertis omfattar dataintegration, analys och visualisering med hjälp av Python, R, SQL och molnbaserade plattformar. Jag är specialiserad på att utnyttja maskininlärning och avancerade statistiska metoder för att identifiera användbara insikter från komplexa dataset. Dessutom har jag omfattande erfarenhet av bioinformatikverktyg, genombrowsers och omicsdata, vilket gör det möjligt för mig att framgångsrikt hantera tvärvetenskapliga forskningsutmaningar.

    Under min doktorandforskning utvecklade jag ett klassificeringsramverk för astma baserat på data från flera kohorter, där jag identifierade molekylära och kliniska signaturer genom genreglering med hjälp av enhancers. Jag fortsätter att bygga vidare på denna expertis genom att bidra till banbrytande projekt inom biostatistik och klinisk dataanalys.

Artiklar

  • Article: HELIYON. 2024;10(14):e34386
    Akhter T; Mileti E; Kere MM; Kolmert J; Konradsen JR; Hedlin G; Melen E; Daub CO
  • Journal article: EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL-SPECIAL TOPICS. 2020;229(24):3675-4284
    Assmann RW; Weikum MK; Akhter T; Alesini D; Alexandrova AS; Anania MP; Andreev NE; Andriyash I; Artioli M; Aschikhin A; Audet T; Bacci A; Barna IF; Bartocci S; Bayramian A; Beaton A; Beck A; Bellaveglia M; Beluze A; Bernhard A; Biagioni A; Bielawski S; Bisesto FG; Bonatto A; Boulton L; Brandi F; Brinkmann R; Briquez F; Brottier F; Bründermann E; Büscher M; Buonomo B; Bussmann MH; Bussolino G; Campana P; Cantarella S; Cassou K; Chancé A; Chen M; Chiadroni E; Cianchi A; Cioeta F; Clarke JA; Cole JM; Costa G; Couprie M-E; Cowley J; Croia M; Cros B; Crump PA; D’Arcy R; Dattoli G; Del Dotto A; Delerue N; Del Franco M; Delinikolas P; De Nicola S; Dias JM; Di Giovenale D; Diomede M; Di Pasquale E; Di Pirro G; Di Raddo G; Dorda U; Erlandson AC; Ertel K; Esposito A; Falcoz F; Falone A; Fedele R; Ferran Pousa A; Ferrario M; Filippi F; Fils J; Fiore G; Fiorito R; Fonseca RA; Franzini G; Galimberti M; Gallo A; Galvin TC; Ghaith A; Ghigo A; Giove D; Giribono A; Gizzi LA; Grüner FJ; Habib AF; Haefner C; Heinemann T; Helm A; Hidding B; Holzer BJ; Hooker SM; Hosokai T; Hübner M; Ibison M; Incremona S; Irman A; Iungo F; Jafarinia FJ; Jakobsson O; Jaroszynski DA; Jaster-Merz S; Joshi C; Kaluza M; Kando M; Karger OS; Karsch S; Khazanov E; Khikhlukha D; Kirchen M; Kirwan G; Kitégi C; Knetsch A; Kocon D; Koester P; Kononenko OS; Korn G; Kostyukov I; Kruchinin KO; Labate L; Le Blanc C; Lechner C; Lee P; Leemans W; Lehrach A; Li X; Li Y; Libov V; Lifschitz A; Lindstrøm CA; Litvinenko V; Lu W; Lundh O; Maier AR; Malka V; Manahan GG; Mangles SPD; Marcelli A; Marchetti B; Marcouillé O; Marocchino A; Marteau F; Martinez de la Ossa A; Martins JL; Mason PD; Massimo F; Mathieu F; Maynard G; Mazzotta Z; Mironov S; Molodozhentsev AY; Morante S; Mosnier A; Mostacci A; Müller A-S; Murphy CD; Najmudin Z; Nghiem PAP; Nguyen F; Niknejadi P; Nutter A; Osterhoff J; Oumbarek Espinos D; Paillard J-L; Papadopoulos DN; Patrizi B; Pattathil R; Pellegrino L; Petralia A; Petrillo V; Piersanti L; Pocsai MA; Poder K; Pompili R; Pribyl L; Pugacheva D; Reagan BA; Resta-Lopez J; Ricci R; Romeo S; Rossetti Conti M; Rossi AR; Rossmanith R; Rotundo U; Roussel E; Sabbatini L; Santangelo P; Sarri G; Schaper L; Scherkl P; Schramm U; Schroeder CB; Scifo J; Serafini L; Sharma G; Sheng ZM; Shpakov V; Siders CW; Silva LO; Silva T; Simon C; Simon-Boisson C; Sinha U; Sistrunk E; Specka A; Spinka TM; Stecchi A; Stella A; Stellato F; Streeter MJV; Sutherland A; Svystun EN; Symes D; Szwaj C; Tauscher GE; Terzani D; Toci G; Tomassini P; Torres R; Ullmann D; Vaccarezza C; Valléau M; Vannini M; Vannozzi A; Vescovi S; Vieira JM; Villa F; Wahlström C-G; Walczak R; Walker PA; Wang K; Welsch A; Welsch CP; Weng SM; Wiggins SM; Wolfenden J; Xia G; Yabashi M; Zhang H; Zhao Y; Zhu J; Zigler A
  • Journal article: JOURNAL OF PHYSICS: CONFERENCE SERIES. 2019;1350(1):012059
    Weikum MK; Akhter T; Alesini D; Alexandrova AS; Anania MP; Andreev NE; Andriyash IA; Aschikhin A; Assmann RW; Audet T; Bacci A; Barna IF; Beaton A; Beck A; Beluze A; Bernhard A; Bielawski S; Bisesto FG; Brandi F; Brinkmann R; Bruendermann E; Büscher M; Bussmann MH; Bussolino G; Chance A; Chen M; Chiadroni E; Cianchi A; Clarke JA; Cole J; Couprie ME; Croia M; Cros B; Crump PA; Dattoli G; Del Dotto A; Delerue N; De Nicola S; Dias JM; Dorda U; Fedele R; Pousa AF; Ferrario M; Filippi F; Fiore G; Fonseca RA; Galimberti M; Gallo A; Ghaith A; Giove D; Giribono A; Gizzi LA; Grüner FJ; Habib AF; Haefner C; Heinemann T; Hidding B; Holzer BJ; Hooker SM; Hosokai T; Huebner M; Irman A; Jafarinia FJ; Jaroszynski DA; Joshi C; Kaluza M; Kando M; Karger OS; Karsch S; Khazanov E; Khikhlukha D; Knetsch A; Kocon D; Koester P; Kononenko OS; Korn G; Kostyukov I; Kruchinin KO; Labate L; Le Blanc C; Lechner C; Leemans W; Lehrach A; Li X; Libov V; Lifschitz A; Litvinenko V; Lu W; Lundh O; Maier AR; Malka V; Manahan GG; Mangles SPD; Marchetti B; de la Ossa AM; Martins JL; Mason PD; Massimo F; Mathieu F; Maynard G; Mazzotta Z; Molodozhentsev AY; Mostacci A; Mueller A-S; Murphy CD; Najmudin Z; Nghiem PAP; Nguyen F; Niknejadi P; Osterhoff J; Espinos DO; Papadopoulos DN; Patrizi B; Petrillo V; Pocsai MA; Poder K; Pompili R; Pribyl L; Pugacheva D; Rajeev PP; Romeo S; Conti MR; Rossi AR; Rossmanith R; Roussel E; Sahai AA; Sarri G; Schaper L; Scherkl P; Schramm U; Schroeder CB; Scifo J; Serafini L; Sheng ZM; Siders C; Silva LO; Silva T; Simon C; Sinha U; Specka A; Streeter MJV; Svystun EN; Symes D; Szwaj C; Tauscher GE; Terzani D; Thompson N; Toci G; Tomassini P; Torres R; Ullmann D; Vaccarezza C; Vannini M; Vieira JM; Villa F; Wahlstrom C-G; Walczak R; Walker PA; Wang K; Welsch CP; Wiggins SM; Wolfenden J; Xia G; Yabashi M; Zhu J; Zigler A
  • Article: INFLAMMATORY BOWEL DISEASES. 2019;25(2):306-316
    Drobin K; Assadi G; Hong M-G; Andersson E; Fredolini C; Forsstrom B; Reznichenko A; Akhter T; Ek WE; Bonfiglio F; Hansen MB; Sandberg K; Greco D; Repsilber D; Schwenk JM; D'Amato M; Halfvarson J
  • Article: PLOS ONE. 2012;7(12):e50758
    Angeletti D; Albrecht L; Blomqvist K; del Pilar Quintana M; Akhter T; Bachle SM; Sawyer A; Sandalova T; Achour A; Wahlgren M; Moll K

Alla övriga publikationer

  • Doctoral thesis: 2024
    Akhter T
  • Conference publication: AIP CONFERENCE PROCEEDINGS. 2019;2160(1):040012
    Weikum MK; Akhter T; Alesini PD; Alexandrova AS; Anania MP; Andreev NE; Andriyash I; Aschikhin A; Assmann RW; Audet T; Bacci A; Barna IF; Beaton A; Beck A; Beluze A; Bernhard A; Bielawski S; Bisesto FG; Brandi F; Bringer O; Brinkmann R; Bründermann E; Büscher M; Bussmann M; Bussolino GC; Chance A; Chanteloup JC; Chen M; Chiadroni E; Cianchi A; Clarke J; Cole J; Couprie ME; Croia M; Cros B; Crump P; Dattoli G; Delerue N; Delferriere O; Delinikolas P; De Nicola S; Dias J; Dorda U; Fedele R; Pousa AF; Ferrario M; Filippi F; Fils J; Fiore G; Fonseca RA; Galimberti M; Gallo A; Garzella D; Gastinel P; Giove D; Giribono A; Gizzi LA; Grüner FJ; Habib AF; Heinemann T; Hidding B; Holzer BJ; Hooker SM; Hosokai T; Hübner M; Irman A; Jafarinia F; Jaroszynski DA; Jaster-Merz S; Joshi C; Kaluza MC; Kando M; Karger OS; Karsch S; Khazanov E; Khikhlukha D; Knetsch A; Kocon D; Koester P; Kononenko O; Korn G; Kostyukov I; Kruchinin K; Labate L; Lechner C; Leemans WP; Lehrach A; Li FY; Li X; Libov V; Lifschitz A; Litvinenko V; Lu W; Lundh O; Maier AR; Malka V; Manahan GG; Mangles SPD; Marchetti B; Marocchino A; de la Ossa AM; Martins JL; Mason P; Massimo F; Mathieu F; Maynard G; Mazzotta Z; Mehrling TJ; Molodozhentsev AY; Mostacci A; Müller AS; Murphy CD; Najmudin Z; Nghiem PAP; Nguyen F; Niknejadi P; Osterhoff J; Papadopoulos D; Patrizi B; Petrillo V; Pocsai MA; Poder K; Pompili R; Pribyl L; Pugacheva D; Romeo S; Rajeev PP; Conti MR; Rossi AR; Rossmanith R; Roussel E; Sahai AA; Sarri G; Schaper L; Scherkl P; Schramm U; Schroeder CB; Schwindling J; Scifo J; Serafini L; Sheng ZM; Silva LO; Silva T; Simon C; Sinha U; Specka A; Streeter MJV; Svystun EN; Symes D; Szwaj C; Tauscher G; Terzani D; Thompson N; Toci G; Tomassini P; Torres R; Ullmann D; Vaccarezza C; Vannini M; Vieira JM; Villa F; Wahlström C-G; Walczak R; Walker PA; Wang K; Welsch CP; Wolfenden J; Xia G; Yabashi M; Yu L; Zhu J; Zigler A

Anställningar

  • Systemutvecklare, Medicinsk epidemiologi och biostatistik, Karolinska Institutet, 2024-

Examina och utbildning

  • Medicine Doktorsexamen, Institutionen för medicin, Huddinge, Karolinska Institutet, 2024

Nyheter från KI

Kalenderhändelser från KI