Peter Svensson
- Institutionen för medicin, Huddinge
- Peter Svenssons forskargrupp
Om mig
Jag är senior forskare och docent i funktionell genomik vid institutionen för medicin, Huddinge, Karolinska Institutet. Jag leder en oberoende forskargrupp inriktad på de epigenetiska och kromatinbaserade mekanismer som styr HIV-1-transkription, latens och upprätthållandet av virusreservoaren – med det långsiktiga målet att bidra till ett funktionellt botemedel mot HIV.
Jag doktorerade 2006 vid Leiden University Medical Center (Nederländerna) och Uppsala universitet. Därefter genomförde jag postdoktoral utbildning i Leona Samsons laboratorium vid Massachusetts Institute of Technology (MIT). År 2010 etablerade jag min forskargrupp vid Karolinska Institutet. Mellan 2015 och 2017 var jag gästforskare vid Gladstone Institute of Virology and Immunology i San Francisco. Min forskning har utförts i nära samarbete med kliniska HIV-forskare och internationella partners, vilket återspeglar ett engagemang för translationell påverkan.
Forskningsbeskrivning
HIV-1-infektion är fortfarande en av de största utmaningarna inom global hälsa. Även om nuvarande antiretroviral behandling är mycket effektiv för att undertrycka virusreplikation och har förvandlat HIV till ett hanterbart kroniskt tillstånd, eliminerar den inte proviruset i infekterade celler. Det grundläggande hindret för ett botemedel är den kvarvarande virusreservoaren: celler där HIV-1-genomet är integrerat som ett provirus men förblir transkriptionellt tyst, osynligt för immunsystemet och okänsligt för antivirala läkemedel. När behandlingen avbryts kommer denna reservoar nästan oundvikligen att återskapa virala produkter.
Forskningsgruppen undersöker hur kromatinstruktur och epigenetiska mekanismer kontrollerar HIV-1-transkription och övergången mellan aktiv replikation och latens. Vi är särskilt intresserade av HIV-1-provirusets öde i de stabilt infekterade primära CD4+ T-cellerna. Ett centralt resultat från vårt arbete är att latenta provirus inte är epigenetiskt enhetliga: provirus inbäddade i heterokromatin kräver mycket för reaktivering, medan provirus som bär f”enhancer”-liknande kromatinegenskaper lätt induceras. Denna distinktion har viktiga implikationer för att förstå vilka infekterade celler som driver viral aktivitet och hur reservoaren bibehålls över tid.
På senare tid har vi utökat vårt fokus till att omfatta genomomfattande karakterisering av HIV-1-reservoaren med hjälp av funktionella kromatinprofileringsmetoder. Vi har identifierat en roll för enzymet PADI4 och histon H3-citrullinering i regleringen av provirala tillstånd. Våra studier syftar till att ge mekanistiska insikter som kan ligga till grund för den rationella utformningen av botemedelsorienterade strategier, inklusive metoder för att selektivt återaktivera och eliminera den latenta reservoaren, eller för att förstärka latens för att uppnå varaktig remission.
Undervisning
Kursledare MTLS Degree project in Molecular Life Science (5MT016)
Undervisning i Genetics, Genomics and Functional Genomics (1BI050), Biomedical Research Literacy (4BI134), Epigenetics and its Clinical Applications (2601), Human Viral Diseases: Mechanisms and Pathogenesis.
Artiklar
- Article: NATURE COMMUNICATIONS. 2025;16(1):5393Love L; Juette BB; Lindqvist B; Rohdjess H; Kieri O; Nowak P; Svensson JP
- Article: FRONTIERS IN IMMUNOLOGY. 2022;13:1067767Milao JF; Love L; Gourgi G; Derhaschnig L; Svensson JP; Soennerborg A; van Domselaar R
- Article: PLOS PATHOGENS. 2022;18(6):e1010555Lindqvist B; Jutte BB; Love L; Assi W; Roux J; Sonnerborg A; Tezil T; Verdin E; Svensson JP
- Article: COMMUNICATIONS BIOLOGY. 2022;5(1):357Svensson Akusjarvi S; Krishnan S; Jutte BB; Ambikan AT; Gupta S; Rodriguez JE; Vegvari A; Sperk M; Nowak P; Vesterbacka J; Svensson JP; Sonnerborg A; Neogi U
- Article: NATURE COMMUNICATIONS. 2021;12(1):4800Shoaib M; Chen Q; Shi X; Nair N; Prasanna C; Yang R; Walter D; Frederiksen KS; Einarsson H; Svensson JP; Liu CF; Ekwall K; Lerdrup M; Nordenskiold L; Sorensen CS
- Article: NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2020;48(13):7154-7168Sanso M; Parua PK; Pinto D; Svensson JP; Pag V; Bitton DA; MacKinnon S; Garcia P; Hidalgo E; Bahler J; Tanny JC; Fisher RP
- Article: EPIGENETICS. 2020;15(6-7):702-714Varnoosfaderani FS; Palau A; Dong W; Persson J; Durand-Dubief M; Svensson JP; Lennartsson A
- Article: SCIENTIFIC REPORTS. 2020;10(1):6055Dong W; Oya E; Zahedi Y; Prasad P; Svensson JP; Lennartsson A; Ekwall K; Durand-Dubief M
- Article: PLOS PATHOGENS. 2020;16(1):e1008264Lindqvist B; Akusjarvi SS; Sonnerborg A; Dimitriou M; Svensson JP
- Article: LIFE SCIENCE ALLIANCE. 2019;2(5):e201900433Ait-Saada A; Khorosjutina O; Chen J; Kramarz K; Maksimov V; Svensson JP; Lambert S; Ekwall K
- Article: ELIFE. 2018;7:e34655Battivelli E; Dahabieh MS; Abdel-Mohsen M; Svensson JP; Da Silva IT; Cohn LB; Gramatica A; Deeks S; Greene WC; Pillai SK; Verdin E
- Article: CELL HOST & MICROBE. 2016;20(6):785-797Besnard E; Hakre S; Kampmann M; Lim HW; Hosmane NN; Martin A; Bassik MC; Verschueren E; Battivelli E; Chan J; Svensson JP; Gramatica A; Conrad RJ; Ott M; Greene WC; Krogan NJ; Siliciano RF; Weissman JS; Verdin E
- Article: EMBO REPORTS. 2015;16(12):1673-1687Sadeghi L; Prasad P; Ekwall K; Cohen A; Svensson JP
- Article: MOLECULAR CELL. 2015;59(6):984-997Zhao H; Sifakis EG; Sumida N; Millan-Arino L; Scholz BA; Svensson JP; Chen X; Ronnegren AL; de Lima CDM; Varnoosfaderani FS; Shi C; Loseva O; Yammine S; Israelsson M; Rathje L-S; Nemeti B; Fredlund E; Helleday T; Imreh MP; Gondor A
- Article: GENOME RESEARCH. 2015;25(6):872-883Svensson JP; Shukla M; Menendez-Benito V; Norman-Axelsson U; Audergon P; Sinha I; Tanny JC; Allshire RC; Ekwall K
- Article: NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY. 2014;21(3):236-243Sadeghi L; Siggens L; Svensson JP; Ekwall K
- Article: PLOS ONE. 2013;8(9):e73736Svensson JP; Pesudo LQ; McRee SK; Adeleye Y; Carmichael P; Samson LD
- Article: LAB ON A CHIP. 2013;13(14):2754-2763Vahey MD; Pesudo LQ; Svensson JP; Samson LD; Voldman J
- Article: EMBO JOURNAL. 2012;31(23):4388-4403Pointner J; Persson J; Prasad P; Norman-Axelsson U; Stralfors A; Khorosjutina O; Krietenstein N; Svensson JP; Ekwall K; Korber P
- Article: PLOS GENETICS. 2012;8(9):e1002985Choi ES; Stralfors A; Catania S; Castillo AG; Svensson JP; Pidoux AL; Ekwall K; Allshire RC
- Article: MOLECULAR CELL. 2012;46(5):691-704Ryan CJ; Roguev A; Patrick K; Xu J; Jahari H; Tong Z; Beltrao P; Shales M; Qu H; Collins SR; Kliegman JI; Jiang L; Kuo D; Tosti E; Kim H-S; Edelmann W; Keogh M-C; Greene D; Tang C; Cunningham P; Shokat KM; Cagney G; Svensson JP; Guthrie C; Espenshade PJ; Ideker T; Krogan NJ
- Article: PLOS ONE. 2012;7(5):e37368Svensson JP; Fry RC; Wang E; Somoza LA; Samson LD
- Article: BMC SYSTEMS BIOLOGY. 2011;5:157Svensson JP; Pesudo LQ; Fry RC; Adeleye YA; Carmichael P; Samson LD
- Article: PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY. 2011;7(8):e1002163Sadeghi L; Bonilla C; Stralfors A; Ekwall K; Svensson JP
- Article: GENES & DEVELOPMENT. 2008;22(19):2621-2626Fry RC; Svensson JP; Valiathan C; Wang E; Hogan BJ; Bhattacharya S; Bugni JM; Whittaker CA; Samson LD
- Article: PLOS ONE. 2007;2(11):e1252Rusyn I; Fry RC; Begley TJ; Klapacz J; Svensson JP; Ambrose M; Samson LD
- Journal article: PLOS GENETICS. 2007;3(11):2180-2189Fry RC; Navasumrit P; Valiathan C; Svensson JP; Hogan BJ; Luo M; Bhattacharya S; Kandjanapa K; Soontararuks S; Nookabkaew S; Mahidol C; Ruchirawat M; Samson LD
- Article: PLOS GENETICS. 2007;3(11):e207Fry RC; Navasumrit P; Valiathan C; Svensson JP; Hogan BJ; Luo M; Bhattacharya S; Kandjanapa K; Soontararuks S; Nookabkaew S; Mahidol C; Ruchirawat M; Samson LD
- Article: MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS. 2007;617(1-2):58-70Kruse JJCM; Svensson JP; Huigsloot M; Giphart-Gassler M; Schoonen WGEJ; Polman JEM; Horbach GJ; van de Water B; Vrieling H
- Article: JOURNAL OF BONE AND MINERAL RESEARCH. 2007;22(1):19-28van Bezooijen RL; Svensson JP; Eefting D; Visser A; van der Horst G; Karperien M; Quax PHA; Vrieling H; Papapoulos SE; ten Dijke P; Lowik CWGM
- Article: PLOS MEDICINE. 2006;3(10):1904-1914Svensson JP; Stalpers LJA; Esveldt-van Lange REE; Franken NAP; Haveman J; Klein B; Turesson I; Vrieling H; Giphart-Gassler M
- Article: MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS. 2005;578(1-2):43-52Tafrechi RSJ; Svensson PJ; Janssen GMC; Szuhai K; Maassen JA; Raap AK
- Article: BMC BIOINFORMATICS. 2005;6:177Svensson JP; de Menezes RX; Turesson I; Giphart-Gassler M; Vrieling H
- Article: BMC GENOMICS. 2005;6:6Boerma M; van der Wees CGC; Vrieling H; Svensson JP; Wondergem J; van der Laarse A; Mullenders LHF; van Zeeland AA
- Visa fler
Alla övriga publikationer
- Conference publication: GUT PATHOGENS. 2026;26:228Kieri O; Narayanan A; Svensson P; Sonnerborg A; Ray S; Nowak P
- Preprint: RESEARCH SQUARE. 2025Kieri O; Narayanan A; Jütte BB; Svensson P; Aleman S; Sönnerborg A; Ray S; Nowak P
- Preprint: BIORXIV. 2024Love L; Jütte B; Lindqvist B; Rohdjess H; Kieri O; Nowak P; Svensson P
- Preprint: RESEARCH SQUARE. 2021Akusjärvi SS; Krishnan S; Jütte B; Ambikan A; Gupta S; Rodriguez J; Vegvari A; Sperk M; Nowak P; Vesterbacka J; Svensson P; Sonnerborg A; Neogi U
- Preprint: BIORXIV. 2021Lindqvist B; Assi W; Roux J; Love L; Jütte B; Sönnerborg A; Tezil T; Verdin E; Verdin E; Svensson P
- Review: FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY. 2021;11:668637Svensson JP
- Preprint: BIORXIV. 2018Sumida N; Sifakis E; Scholz B; Fernandez-Woodbridge A; Kiani N; Gomez-Cabrero D; Svensson P; Tegner J; Göndör A; Ohlsson R
- Preprint: BIORXIV. 2018Battivelli E; Dahabieh M; Abdel-Mohsen M; Svensson P; Tojal Da Silva I; Cohn L; Gramatica A; Deeks S; Greene W; Pillai S; Verdin E
- Preprint: BIORXIV. 2017Sansó M; Pinto D; Svensson P; Pagé V; Parua P; Bitton D; Mbogning J; Garcia P; Hidalgo E; Robert F; Bähler J; Tanny J; Fisher R
- Editorial: EPIGENOMICS. 2014;6(5):451-454Svensson JP; Ekwall K
- Other: PERSONALIZED MEDICINE. 2008;5(6):561-563Fry RC; Svensson JP; Valiathan C
- Conference publication: ENVIRONMENTAL AND MOLECULAR MUTAGENESIS. 2008;49(7):578Quiros L; Svensson P; Wang E; Fry R; Samson LD
- Conference publication: ENVIRONMENTAL AND MOLECULAR MUTAGENESIS. 2008;49(7):578Svensson P; Rebecca FR; Samson LD
- Conference publication: BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS. 2004;1657:82Jahangir R; Svensson P; Janssen G; Szuhai K; Maassen JA; Raap A
Forskningsbidrag
- Swedish Research Council1 January 2025 - 31 December 2028The research project’s purpose is to explore the intricate dynamics of host-virus interactions. The primary aim is to understand how viral DNA, once integrated into the human genome, is regulated at the transcriptional level. This understanding is crucial for chronic infections like HIV-1, where the virus becomes a part of the host’s genetic material. Although HIV-1 is the primary focus of this project, we seek to generalize our finding to other viruses, such as HPV and HBV that also can integrate into the genome.The research will be carried out using state-of-the-art techniques, allowing precise mapping of viral DNA, visualization of chromatin microenvironment at the single cell level, and functional modifications of enginereed proteins. These techniques will provide unprecedented insights into the dynamics of host-virus interactions. Contingency plans exist to optimize the possibilities for success.The project is organized around a team of experts in virology, immunology, and epigenetics. We will collaborate with clinicians at Karolinska University Hospital (Sweden) and Mass Gen Hospital (US). The project will span over four years, allowing for thorough investigation and analysis.This research has potential to significantly advance our understanding of viral infections and their long-term impact. By exploring manipulation of epigenetic control mechanisms, the research could pave the way for novel treatment strategies in precision medicine.
- Swedish Research Council1 January 2020 - 31 December 2022
- Swedish Research Council1 January 2016 - 31 December 2018
Anställningar
- Senior Forskare, Medicin, Huddinge, Karolinska Institutet, 2024-
Examina och utbildning
- Docent, Funktionell genomforskning, Karolinska Institutet, 2012
