Pavan Asalapuram
Från påvisad resistens till konkreta kliniska och folkhälsomässiga beslut | Molekylär diagnostik · ML-baserad resistensprediktion · Läkemedelsresistent tuberkulos · Antibiotikastyrning.
Om mig
Jag är forskare i forskargruppen Hälsosystem och policy, ledd av professor Cecilia Stålsby Lundborg, och utvecklar diagnostisk beslutsinfrastruktur för läkemedelsresistenta infektioner. Tuberkulos är mitt huvudsakliga modellsystem, och samma ansats är tillämpbar på andra bakteriella och zoonotiska infektioner där påvisning, resistenstolkning och val av antibiotika hänger samman.
Att påvisa resistens är bara det första steget. Värdet avgörs av om resultatet tolkas och omsätts i bättre beslut: rätt behandling för den enskilda patienten och en mer ändamålsenlig antibiotikaanvändning i hälsosystemen och i kontrollen av antimikrobiell resistens (AMR) på befolkningsnivå. Mitt arbete följer denna kedja: påvisa, tolka, besluta, implementera och övervaka.
Jag har omkring två decenniers erfarenhet av diagnostik för infektionssjukdomar, från testutveckling och klinisk utvärdering i Europa, Asien och Afrika till regulatoriskt godkännande och kvalitetscertifierad tillverkning. Jag ledde utvecklingen av ett molekylärt test för multiresistent tuberkulos som ingår i Treatment Action Groups TB Diagnostics Pipeline 2024 och som omnämns i WHO:s Global Tuberculosis Report 2024.
Forskningsbeskrivning
Min forskning förenar fyra områden:
- Påvisning: snabb multiplex molekylär diagnostik för läkemedelsresistenta infektioner, inklusive tuberkulos samt luftvägs- och zoonotiska patogener.
- Tolkning: maskininlärningsmodeller som förutsäger vilka resistensassocierade mutationer som är kliniskt relevanta, med början i bedakvilin och BPaLM-regimen, där sambandet mellan genotyp och fenotyp fortfarande är oklart.
- Beslut: hur diagnostiska resultat omsätts i jämlika behandlingsbeslut och en mer ändamålsenlig antibiotikaanvändning, samt sjukdomsbördan över hela livet, som gör dessa beslut så betydelsefulla.
- Implementering och övervakning: hälsoarkitektur på hushållsnivå, diagnostiska luckor i One Health-övervakningen av AMR, samt kopplingen mellan diagnostiska data, övervakning och policy.
En central fråga för mitt arbete är: Hur kan påvisad resistens omsättas i snabba och jämlika kliniska och folkhälsomässiga beslut?
Jag välkomnar samarbeten inom läkemedelsresistenta infektioner, AMR, antibiotikastyrning, tuberkulos, One Health, diagnostik, maskininlärning för resistensprediktion, implementeringsforskning och hälsopolicy.
Undervisning
Jag undervisar vid Karolinska Institutet, KTH och Uppsala universitet och har handlett examensarbeten på masternivå inom global hälsa, med inriktning mot diagnostik, den globala sjukdomsbördan och policyimplementering.
Artiklar
- Article: FRONTIERS IN TUBERCULOSIS. 2025;3:1536600Asalapuram P; Hoffner S
- Article: INTERNATIONAL JOURNAL OF MYCOBACTERIOLOGY. 2024;13(1):91-95Ramasubban G; Michael J; Gupta R; Venkatesan M; Beauton A; Hoffner S; Asalapuram P
- Article: ANALYTICA CHIMICA ACTA. 2018;1025:118-123Pavankumar AR; Zelenin S; Lundin A; Schulte T; Rajarathinam K; Rebellato P; Ardabili S; Salas J; Achour A; Russom A
- Article: ANALYTICAL CHEMISTRY. 2016;88(8):4277-4284Pavankumar AR; Engstrom A; Liu J; Herthnek D; Nilsson M
- Article: JOURNAL OF CHEMICAL TECHNOLOGY AND BIOTECHNOLOGY. 2015;90(8):1521-1526Pavankumar AR; Singh L
- Article: CLEAN-SOIL AIR WATER. 2015;43(3):456-461Singh L; Sharma P; Pavankumar AR
- Article: JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY. 2014;63(Pt 12):1595-1607Praekelt U; Reissbrodt R; Kresse A; Pavankumar A; Sankaran K; James R; Jesudason M; Anandan S; Prakasam A; Balaji V; Dutta S; Dutta S; Ramamurthy T; Fischer R; Sander P; Schaumann R; Navarro A; Williams P
- Article: INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCE AND TECHNOLOGY. 2014;11(4):873-880Bodlund I; Pavankumar AR; Chelliah R; Kasi S; Sankaran K; Rajarao GK
- Article: JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. 2014;32(3):406-415Pavankumar AR; Kayathri R; Murugan NA; Zhang Q; Srivastava V; Okoli C; Bulone V; Rajarao GK; Agren H
- Article: RSC ADVANCES. 2014;4(14):7136-7141Pavankumar AR; Noren J; Singh L; Gowda NKC
- Article: JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. 2013;31(10):1182-1190Okoli C; Sengottaiyan S; Murugan NA; Pavankumar AR; Agren H; Rajarao GK
- Article: BIOTECHNIQUES. 2012;52(3):167-172Pavankumar AR; Ayyappasamy SP; Sankaran K
- Article: ECOLOGICAL ENGINEERING. 2012;38(1):119-124Singh L; Pavankumar AR; Lakshmanan R; Rajarao GK
- Article: JOURNAL OF ANTIBIOTICS. 2009;62(7):377-384Alagumaruthanayagam A; Pavankumar AR; Vasanthamallika TK; Sankaran K
- Article: DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE. 2009;63(3):243-250Sankaran K; Banerjee S; Pavankumar AR; Jesudason M; Reissbrodt R; Williams PH
Alla övriga publikationer
- Published conference paper: INTERNATIONAL JOURNAL OF MYCOBACTERIOLOGY. 2026;S8(Special Issue 2026 – Abstracts):s8Pavan A; Nikhil S; Vasim A; Narayanan M; Stålsby Lundborg C
- Meeting summary: INTERNATIONAL JOURNAL OF MYCOBACTERIOLOGY. 2026;15(pS9):s9Asalapuram P
- Patent: 2025Portable and adaptive modular sterilization and lubrication system and applicationsAsalapuram P
- Patent: 2025One-Step Intercepting polymerase chain reaction (IntPCR) for simultaneous detection of wildtypes and selective point mutations and applications thereofAsalapuram P; Nikhil S
- Patent: 2025Analytical, clinical and interdisciplinary applications utilizing Shigella flexneri apyraseAsalapuram P
- Patent: 2024Novel coating and immobilization buffer for antigens and antibodies and uses thereofAsalapuram P; Nikhil S; Krishnan S
- Patent: 2022Modified Shigella apyrase and uses thereofAsalapuram P; Nikhil S
- Patent: 2017Diagnostic device and related methodAsalapuram P; Mats NB
- Patent: 2016Analytical and diagnostic methods utilizing Shigella flexneri apyraseAsalapuram P; Aman R
- Patent: 2009A method to detect the microbial resistance to antibiotics using fluorescenceAsalapuram P; Krishnan S; Alagumaruthanayagam A
- Review: FOOD TECHNOLOGY AND BIOTECHNOLOGY. 2008;46(2):125-145The Need and New Tools for Surveillance of Escherichia coli PathogensAsalapuram P; Krishnan Sankaran
- Report: 2005;:26Characterization of diarrhoeagenic E. coli (EPEC and EHEC) from incidences of infantile diarrhoeaAsalapuram P
Forskningsbidrag
- Exploring mlfoDx MDR-TB diagnostic platform in Africa and Latin American marketsBusiness Sweden1 november 2023Grant awarded in the capacity of Co-founder & CEO of EMPE Diagnostics AB, Sweden- to validate the business and marketing opportunity.
- Rapid Affordable Reliable-ELISA (RAR-ELISA) platform for the diagnosis of important helminthic infectionsDepartment of Biotechnology , Ministry of Science and Technology1 juni 2023 - 31 december 2024
- Multiplex Diagnostic Platform for Accurate and Rapid Detection of MDR & pre-XDR-TBIPE Global1 januari 2023Grant awarded in the capacity of Co-founder & CEO of EMPE Diagnostics AB, Sweden- to validate the multiplex molecular test.
- Adaptable multi-flow diagnostics for multidrug-resistant TB using tongue swabsBill and Melinda Gates Foundation1 november 2022PI and Coordinator: Grant awarded in the capacity of Co-founder & CEO of EMPE Diagnostics AB, Sweden- to develop and validate Adaptable multi-flow diagnostics for multidrug-resistant TB using tongue swabs.
- AdvanceTB: Towards an improvement in diagnostics and treatment strategies for tuberculosis control1 september 2022 - 30 september 2026
- mfloDx: An Adaptable Multiflow Diagnostic Platform to Genetically Identify Drug Resistant InfectionEuropean Commission Directorate-General for Research and Innovation1 januari 2020 - 30 juni 2024
- mfloDx: An Adaptable Multiflow Diagnostic Platform to Genetically Identify Drug Resistant InfectionEuropean Commission Directorate-General for Research and Innovation1 oktober 2019 - 29 februari 2020
- RCA-ADT diagnostic platform for the rapid detection of enteric pathogensEPSRC grant1 januari 2016 - 31 december 2017
- A multiplex diagnostic test for multi-drug/extensively drug-resistant tuberculosisVinnova1 november 2013 - 30 september 2016
- Integrated fluidic-array-microsystem for rapid screening of extended spectrum β-lactamases and multidrug resistant pathogens.KTH - Life Science Platform
- Real-time wireless biosensor networks for the surveillance of microbes and pollutants in drinking water supply linesKTK Life Science Technology Platform
- INNOVA4TB: Innovative development to enable individualised tuberculosis treatmentEuropean Commission Directorate-General for Research and Innovation
Anställningar
- Anknuten till Forskning, Global folkhälsa, Karolinska Institutet, 2022-
- Forskningsassistent, Global folkhälsa, Karolinska Institutet, 2026-2027
- CEO, Mitti Lifetek AB, 2019-2024
- Founder & CEO, EMPE Diagnostics AB, 2016-2024
- Postdoctor, Stockholm University, 2013-2016
- Researcher, Biothema AB & KTH, 2012-2013
- Postdoctor, Molecular Diagnostics, Royal Institute of Technology, 2010-2011
Examina och utbildning
- PhD, Clinical Biotechnology, Anna University, Chennai, 2010
- M.S. (res), Clinical Biotechnology, Anna University, Chennai, 2006
- EPGD in Hospital & Health Care Management, Loyola Institute of Business Administration (LIBA), 2002
- B. Pharmacy, Pharmacy, Madras Medical College, Dr MGR Medical University, 2001