Mikael Altun
Forskare | Docent
E-postadress: mikael.altun@ki.se
Besöksadress: Alfred Nobels allé 8, 14152 Huddinge
Postadress: H5 Laboratoriemedicin, H5 Klin Fysiologi, 141 52 Huddinge
Forskningsbeskrivning
- Ubiquitin proteasomsystemet (UPS) spelar en central roll i de flesta cellulära processer. Framväxande data antyder roller för UPS utanför den kända underhållsfunktionen i proteinomsättning och belyser att mer måste göras för att förstå UPS komplexa natur och dess funktioner i cellen. Vi studerar UPS från grundläggande cellulära funktioner och fortsätter mot att förstå dess deltagande i mänskliga sjukdomar, från muskelatrofier till cancer. Dessutom fokuserar våra ansträngningar på att utveckla nya molekylära, kemiska och biofysiska teknologier för att få insikter i komplexa cellulära processer.
Ett centralt fokus, med transnationell potential är att "kapa" UPS för riktad nedbrytning av proteiner med små molekyler, vilket har förmåga att skapa nya terapeutiska strategier. Genom att använda denna metod kan vi förhoppningsvis låsa upp den "oåtkomliga" proteomet och skapa en bättre strategi för att bekämpa sjukdomar där terapeutiska alternativ är begränsade inom de konventionella läkemedelsupptäcktsmetoderna. En sådan riktad nedbrytningsmetod är med bifunktionella molekyler som rekryterar UPS-komponenter för att bryta ner ett målprotein - oftare kallade PROTACs (PROteolysis-TArgeting Chimeras). Medan konventionella små molekyler blockerar aktiviteten hos ett målprotein, tjänar PROTACs till att eliminera proteinet helt genom att leda det till proteasomen för nedbrytning med hjälp av ubiquitinsystemet. Eftersom PROTACs minskar det riktade proteinet mängd i cellen genom nedbrytning på samma sätt som funktionella genetikmetoder (t.ex. RNAi och CRISPR/Cas9) gör, kommer vi sedan kunna korrelera molekylära förändringar och förutsäga cellulära fenotyper mycket bättre - något som traditionella terapeutiska läkemedel vanligtvis inte kan återskapa fullständigt. Dessutom, eftersom traditionella små molekyler alltid plågas av otillbörliga effekter, kan PROTACs betydligt förbättra förutsägbarheten från gen-till-funktion studier.
Ett annat mål är att utveckla bioteknologier för att adressera viktiga vetenskapliga frågor som kräver en cellulär kontext, som övervakning av cellulära protein-ligand interaktioner. Denna forskning leds av min kollega Nicholas Valerie (staff.ki.se/people/nicval). Dr. Altun är gruppledare vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab) i Stockholm, en stor knutpunkt för Sveriges nationella biomedicinska infrastrukturer. (https://www.scilifelab.se/researchers/mikael-altun/ [1]).
[1] https://www.scilifelab.se/researchers/mikael-altun/
Artiklar
- Article: NATURE COMMUNICATIONS. 2024;15(1):10347
- Article: JOURNAL OF CACHEXIA, SARCOPENIA AND MUSCLE. 2024;15(5):2143-2155
- Article: BIOLOGY. 2023;12(9):1177
- Article: COMMUNICATIONS BIOLOGY. 2022;5(1):1121
- Article: CELL DEATH AND DISEASE. 2021;12(10):914
- Article: SCIENCE ADVANCES. 2021;7(32):eabf7561
- Article: MOVEMENT DISORDERS. 2021;36(5):1137-1146
- Article: NUCLEIC ACIDS RESEARCH (NAR). 2020;48(21):12234-12251
- Article: NATURE CHEMICAL BIOLOGY. 2020;16(10):1120-1128
- Article: MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS. 2020;19(4):608-623
- Article: ACTA PHYSIOLOGICA. 2019;227(3):e13335
- Article: ENDOCRINE CONNECTIONS. 2019;8(7):1070-1081
- Journal article: CANCER RESEARCH. 2019;79(13_Supplement):105
- Article: SCIENCE. 2018;362(6416):834-839
- Article: SCIENTIFIC REPORTS. 2018;8(1):11202
- Article: HAEMATOLOGICA. 2018;103(7):1169-1181
- Article: MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY. 2018;14(3):e7858
- Article: PLOS ONE. 2017;12(12):e0188772
- Article: ONCOGENESIS. 2016;5(12):e275
- Article: CELL REPORTS. 2016;14(2):298-309
- Article: PLOS ONE. 2015;10(1):e0115344
- Article: NATURE. 2014;508(7495):215-221
- Article: CHEMISTRY AND BIOLOGY. 2013;20(12):1447-1455
- Article: BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS. 2013;433(4):390-395
- Article: CANCER CELL. 2012;22(3):345-358
- Article: ORGANIC AND BIOMOLECULAR CHEMISTRY. 2012;10(17):3379-3383
- Article: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 2012;287(3):1962-1969
- Article: CHEMISTRY AND BIOLOGY. 2011;18(11):1401-1412
- Article: CHEMISTRY AND BIOLOGY. 2011;18(5):642-654
- Article: CHEMICAL COMMUNICATIONS. 2011;47(5):1488-1490
- Article: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 2010;285(51):39597-39608
- Article: THE FEBS JOURNAL. 2010;277(11):2515-2530
- Article: EMBO REPORTS. 2009;10(7):755-761
- Article: BIOCHEMICAL JOURNAL. 2009;418(2):379-390
- Article: PHYSIOLOGY AND BEHAVIOR. 2007;92(5):911-923
- Article: PHYSIOLOGY AND BEHAVIOR. 2007;92(1-2):129-135
- Article: MUSCLE AND NERVE. 2007;36(2):223-233
- Article: THE JOURNALS OF GERONTOLOGY. SERIES A, BIOLOGICAL SCIENCES AND MEDICAL SCIENCES. 2006;61(7):663-674
- Article: CANCER RESEARCH. 2005;65(17):7896-7901
- Article: AGING CELL. 2003;2(1):47-57
- Article: CHEMISTRY AND BIOLOGY. 2001;8(9):913-929
- Article: JOURNAL OF NEUROSCIENCE METHODS. 2001;108(1):19-24
- Visa fler
Alla övriga publikationer
- Preprint: BIORXIV. 2024
- Preprint: PREPRINTS.ORG. 2023
- Preprint: BIORXIV. 2022
- Preprint: BIORXIV. 2022
- Preprint: BIORXIV. 2021
- Preprint: SSRN ELECTRONIC JOURNAL. 2020
- Meeting abstract: CANCER RESEARCH. 2019;79(13):105
- Conference publication: JOURNAL OF VASCULAR RESEARCH. 2019;56:86
- Editorial comment: CELL CHEMICAL BIOLOGY. 2017;24(12):1429-1431
- Corrigendum: NATURE. 2017;544(7651):508
- Corrigendum: CELL REPORTS. 2016;17(12):3407-3416
- Review: BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA: INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS. 2012;1823(11):2029-2037
- Book chapter: SENESCENCE. 2012;p.
- Thesis / dissertation: 2007
Forskningsbidrag
- Swedish Research Council1 January 2024 - 31 December 2026
- Cancer-specific targeted protein degradation through FBXO22Novo Nordisk Fonden1 February 2022 - 31 August 2023
- Swedish Research Council1 January 2021 - 31 December 2023
- Prevention of Protein Aggregations by Activation of Protein Degradation MechanismsHållsten Foundation1 January 2020
- CANCERPREVEU Horizon 20201 December 2019 - 30 April 2024
- BIPODSciLifeLabs Sweden1 October 2018
- Exploring Deubiquitylating Enzyme for cancer therapyMEDIVIR1 January 2017
- Swedish Research Council1 January 2015 - 31 December 2018
- Research Associate/Assistant Professor in Medical Sciences at Karolinska InstitutetKarolinska Institutet1 January 2014 - 31 December 2017
- Start-up AwardStratNeuro karolinska Institutet1 January 2014
- Hållsten Academy FellowHållsten Foundation1 January 2014
- Targeting the deubiquitylating enzymes in the Nervous system for new insights and novel therapiesJeansson Stiftelse1 January 2013 - 31 December 2015
- Targeting the deubiquitylating enzymes in the Nervous system for new insights and novel therapiesÅhlen Stiftelse1 January 2013 - 31 December 2015
- Swedish Research Council1 January 2012 - 31 December 2014
- Targeting the deubiquitylating enzymes in the Nervous system for new insights and novel therapiesÅke-Wibergs Stiftelse1 January 2012 - 31 December 2015
- Swedish Research Council1 June 2011 - 31 May 2012
Anställningar
- Forskare, Laboratoriemedicin, Karolinska Institutet, 2018-
- Postdoctoral Researcher, Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institute, 2008-2009
Examina och utbildning
- Docent, Cell- och molekylärbiologi, Karolinska Institutet, 2020
- MEDICINE DOKTORSEXAMEN, Institutionen för neurovetenskap, Karolinska Institutet, 2007
- Medicine Magisterexamen, Karolinska Institutet, 2003
Handledare
- Seher Alam, 2024
- Maria Joao Pires, 2020
- Johan Boström, Studying the Cell Cycle using Systems Biology and High Content Characterization of the Ubiquitin Proteasome System., https://openarchive.ki.se/xmlui/handle/10616/47323, 2014
- Daniela Papadia, Cellular and network mechanisms in neurodegenerative disorders : neurotoxicity and rescue strategies., https://openarchive.ki.se/xmlui/handle/10616/46338, 2014
- Saeed Eshtad, Targeting DNA repair Pathways for Cancer Therapy., https://openarchive.ki.se/xmlui/handle/10616/45467, 2012
- Michael Feyder, L-DOPA-induced signaling pathways and neuroepigenetic mechanisms in experimental parkinsonism and dyskinesia., https://openarchive.ki.se/xmlui/handle/10616/42273, 2012
- Bin Zhao, Functional studies of deubiquitinating enzymes., https://openarchive.ki.se/xmlui/handle/10616/41134, 2008
Gästforskning och resestipendier
- Utilizing mass-spectrometry and Chemical Biology to unravel the functions of deubiqutinating enzymes with a special focus on the Otubains, University of Oxford, 2009-2011
Utvärdering av avhandlingsarbete
- Hanzhao Zhang, Examination board member, Departement of Immunology, genetics and pathology, Uppsala University, 2024
- Johannes Gubat, Examination board member, Department of Biomedical and Clinical Sciences, Linköping University, 2024
- Mirko Mandic, Defence chairperson, Laboratory Medicine, Karolinska Institute, Blood volume expansion following supramaximal exercise : occurrence and contribution to maximal oxygen uptake, https://openarchive.ki.se/xmlui/handle/10616/48423, 2023
- Kristijonas Zemaitis, Examination board member, Department of Laboratory Medicine and Lund Stem Cell Center, Lund University, Unravelling mechanisms of hematopoietic stem cell expansion, 2022