Daniel Sorobetea

Daniel Sorobetea

Biträdande Lektor
Besöksadress: Solnavägen 9, 17165 Solna
Postadress: C1 Mikrobiologi, tumör- och cellbiologi, C1 H-M Arulampalam Sorobetea, 171 77 Stockholm
Del av:

Forskningsbeskrivning

  • Mikroorganismer tar varje år livet av miljontals människor världen över, medan ytterligare miljontals lider av kroniska infektioner. Den ökande antibiotikaresistensen hotar de redan begränsade behandlingsalternativen, vilket betonar det akuta behovet av nya terapier. Jag strävar efter att förstå de grundläggande immunmekanismer som skyddar kroppen, med målet att utveckla nya vacciner och behandlingar mot infektionssjukdomar.

    Vissa infektiösa mikrober har utvecklats för att motverka kroppens immunitet, vilket resulterar i kronisk sjukdom. I dessa sammanhang byter immuncellerna strategi och omringar istället mikroberna i strukturer som kallas granulom, vilket tillfälligt förhindrar deras spridning och skada. Även om dessa immunstrukturer i allmänhet betraktas som skyddande utgör de också en nisch som infektionen kan sprida sig från om immunsystemet försvagas, där det främsta exemplet är reaktivering av tuberkulos hos patienter som lider av AIDS. Granulom förekommer i ett stort antal sjukdomar, från histoplasmos och körtelfeber till Hodgkins lymfom och Crohns sjukdom. Trots deras långa historia i den medicinska litteraturen samt deras betydelse för infektionssjukdomar utgör granulom ett problem i kliniska sammanhang eftersom det saknas terapeutiska metoder för att utrota mikroberna inuti dem. Framstegen är få på grund av vår begränsade förståelse av de grundläggande mekanismerna, samt bristen på tillförlitliga djurmodeller som på ett troget sätt fångar de symtom som syns hos människor.

    Yersinia pseudotuberculosis är en bakterie som invaderar tarmen hos människor och orsakar inflammation, speciellt hos barn. Jag har nyligen upptäckt att granulom utgör en nisch för Yersinia i musens tarm och visat att monocyter och neutrofiler i det medfödda immunsystemet är viktiga för att upprätthålla intakta granulom och begränsa bakteriernas spridning vilket ger oss ett nytt verktyg för att undersöka granulomernas grundläggande biologi.

    Jag undersöker för närvarande hur tarmgranulom steriliseras och löses upp över tid. En bättre förståelse för detta förlopp kan möjliggöra nya terapier mot skadliga mikroorganismer som är resistenta mot antibiotika, samt lindra granulomsjukdomar. Jag uppmuntrar er som är intresserade av att bedriva spännande forskning inom både immunologi och mikrobiologi att kontakta mig för lediga tjänster.

Undervisning

  • Undervisning och mentorskap är mina stora passioner och jag föreläser för närvarande på följande kurser:

    BIOR88 - Immunologi och infektionsbiologi - Lunds universitet

    4BI107 - Frontiers in Biomedicine - Karolinska Institutet

    C1F3114 - Molecular Immunology - Karolinska Institutet

    Under min vetenskapliga resa så har jag haft nöjet att arbeta med studenter från många olika bakgrunder, vilket lärt mig att alla kräver olika former av stöd. Mentorskap måste därför skräddarsys efter individens behov och mål, och jag tror att människor presterar som bäst när de kan följa sin egen väg. Min filosofi är därför att ge individerna möjlighet att styra sina projekt i den riktning som de brinner för och ge vägledning på ett sätt som passar dem.

Artiklar

Alla övriga publikationer

Forskningsbidrag

  • Swedish Research Council
    1 January 2024 - 31 December 2027
    Microbial pathogens claim the lives of millions of people worldwide each year, while millions more suffer from chronic infections. Increases in antibiotic resistance threaten to undermine already limited treatment options, highlighting an urgent need for new therapeutic approaches. Granulomas act as barriers to pathogen dissemination and form in response to a wide variety of infections, such as histoplasmosis, leishmaniasis and tuberculosis. Although generally considered protective, these immune structures also provide a replicative niche from which pathogens can spread should the immune system be compromised. A major unanswered question has been how granulomas are sterilized and cleared. Solving this problem would enable us to alleviate granulomatous diseases. Yet, the molecular basis of pathogen restriction within granulomas remains poorly understood.I recently identified granulomas as an unappreciated niche for enteropathogenic Yersinia invasion in the murine intestine. My new preliminary data reveal that intestinal granulomas are sterilized by T lymphocytes, providing a novel tool to dissect the mechanistic basis of granuloma resolution. With my experience in mucosal immunology and microbial pathogenesis, I aim to dissect how T cells orchestrate granuloma resolution to facilitate bacterial control. Altogether, this proposal seeks to uncover fundamental mechanisms of pathogen restriction, with the long-term goal of developing new treatments for granulomatous diseases.
  • Jaenssons Stiftelser
    När kroppen utsätts för en främmande mikroorganism måste immunförsvaret reagera snabbt för att förgöra inkräktaren. Vissa bakterier kan dock manipulera våra immunceller för att hämma deras funktion och på så sätt främja sin egen överlevnad och spridning. I sådana fall byter immunförsvaret strategi och bildar istället så kallade granulom, där cellerna fysiskt omringar bakterierna och förhindrar deras framfart. Granulom uppkommer under många slags infektioner, exempelvis tuberkulos, men vi vet fortfarande otroligt lite om hur de faktiskt fungerar trots årtionden av forskning. Detta beror till stor del på bristen av bra djurmodeller som efterliknar sjukdomsförloppet i mänskliga patienter, vilket betonar vikten av att utveckla nya verktyg för att i detalj kunna studera hur granulom skyddar kroppen. Jag har nyligen etablerat en unik musmodell där granulom naturligt bildas i tarmen under infektion med bakterien Yersinia. Denna infektion är vanligt förekommande i Norden och orsakar allt från mild tarminflammation till dödlig pest. Mina preliminära data visar att en slags vit blodkropp vid namn T-cell spelar en avgörande roll för huruvida granulom fungerar som de ska och lyckas förgöra Yersinia. Möss som på grund av genetiska defekter saknar T-celler är således mycket känsliga för infektion då bakterierna sprider sig ohämmat från tarmen till andra organ i kroppen. Jag ämnar gå vidare med dessa resultat och noggrant undersöka hur T-celler bidrar till fungerande granulom och därmed skyddar mot bakterieinfektion. Jag vill även analysera vävnadsprover från patienter med aktiva granulom. Med tanke på det ökande hotet av antibiotikaresistens är det ytterst viktigt att studera hur bakterier manipulerar kroppen och hur immunförsvaret i sin tur svarar på dessa attacker. En bättre förståelse av dessa förlopp kan hjälpa oss att utveckla nya behandlingar för att bota eller lindra smittsamma infektioner.
  • Definiera skyddande immunitet inom granulom under tarminfektion
    Karolinska Institutet Research Foundation
  • Magnus Bergvalls Stiftelse
    Granulom är kroniska immunstrukturer som bildas vid en rad olika sjukdomar, från tuberkulos och histoplasmos till sarkoidos och Crohns sjukdom. Granulom utgör en nisch där mikrober är skyddade från antibiotika och kan överleva på obestämd tid. En viktig men obesvarad fråga är hur de kan steriliseras. Om vi löser detta problem skulle vi kunna lindra granulomsjukdomar och utrota kroniska infektioner. Trots deras betydelse för många sjukdomsförlopp utgör granulom ett problem i kliniska sammanhang, både på grund av avsaknaden av behandlingar som kan användas mot dessa strukturer samt en bristande förståelse för deras grundläggande biologi. Jag har etablerat en musmodell där granulom naturligt upplöses efter en bakterieinfektion som drabbar människor. Med hjälp av moderna genetiska verktyg kommer jag att undersöka hur tarmgranulom bildas, fungerar och upplöses, vilket möjliggör analyser av de immunmekanismer som krävs för behandlandet av infektiösa granulom. Att förstå hur immunceller kan sterilisera granulom, och framför allt varför detta ofta misslyckas, kommer att lägga grunden till nya terapier för att minska lidandet för patienter med kroniska sjukdomar. Allt som allt syftar detta projekt till att avslöja grundläggande mekanismer för bekämpning av patogena organismer, med det långsiktiga målet att utveckla nya behandlingar för kroniska granulomsjukdomar samt antibiotikaresistenta mikrober.

Anställningar

  • Biträdande Lektor, Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi, Karolinska Institutet, 2024-2028
  • Postdoktoral tjänst, Department of Pathobiology, School of Veterinary Medicine, University of Pennsylvania, 2018-2024

Examina och utbildning

  • Doktorsexamen i immunologi, Immunologiavdelningen, Medicinska fakulteten, Lunds universitet, 2017

Nyheter från KI

Kalenderhändelser från KI