Ping Chens forskning
Vi arbetar med datadriven forskning fokuserat på human kardiometabola sjukdomar
Vi strävar efter att integrera longitudinella patientdata, banbrytande multi-omics-teknologier och nya beräkningsmetoder för att övervaka individuell sjukdomsprogression för att utröna de underliggande sjukdomsdrivande mekanismerna. I synnerhet är vi intresserade av rollerna för immunceller (makrofager, monocyter, dendritceller, etc.) och RNA-splicing-centrerad transkriptionsreglering i sjukdomsprogression.
För närvarande fokuserar vi på fetma och dess associerade metabola sjukdomar, särskilt alkoholfri fettleversjukdom och diabetes.
Forskare Ping Chen
Forskningstekniker
Single-cell omics, Spatial omics, Mass spectrometry, Bioinformatics, Artificial intelligence.
Externa bidragsgivare
Region Stockholm CIMED, Jeanssons Stiftelser and Karolinska Institutet.
Utvalda publikationer
Macrophage functional diversity in NAFLD - more than inflammation.
Barreby E, Chen P, Aouadi M
Nat Rev Endocrinol 2022 Aug;18(8):461-472
Hepatic miR-144 Drives Fumarase Activity Preventing NRF2 Activation During Obesity.
Azzimato V, Chen P, Barreby E, Morgantini C, Levi L, Vankova A, Jager J, Sulen A, Diotallevi M, Shen JX, Miller A, Ellis E, Rydén M, Näslund E, Thorell A, Lauschke VM, Channon KM, Crabtree MJ, Haschemi A, Craige SM, Mori M, Spallotta F, Aouadi M
Gastroenterology 2021 Dec;161(6):1982-1997.e11
Single-cell RNA sequencing reveals the mesangial identity and species diversity of glomerular cell transcriptomes.
He B*, Chen P*, Zambrano S, Dabaghie D, Hu Y, Möller-Hackbarth K, Unnersjö-Jess D, Korkut GG, Charrin E, Jeansson M, Bintanel-Morcillo M, Witasp A, Wennberg L, Wernerson A, Schermer B, Benzing T, Ernfors P, Betsholtz C, Lal M, Sandberg R, Patrakka J
Nat Commun 2021 Apr;12(1):2141
Single-cell RNA counting at allele and isoform resolution using Smart-seq3.
Hagemann-Jensen M, Ziegenhain C, Chen P, Ramsköld D, Hendriks GJ, Larsson AJM, Faridani OR, Sandberg R
Nat Biotechnol 2020 Jun;38(6):708-714
Liver macrophages inhibit the endogenous antioxidant response in obesity-associated insulin resistance.
Azzimato V*, Jager J*, Chen P*, Morgantini C, Levi L, Barreby E, Sulen A, Oses C, Willerbrords J, Xu C, Li X, Shen JX, Akbar N, Haag L, Ellis E, Wålhen K, Näslund E, Thorell A, Choudhury RP, Lauschke VM, Rydén M, Craige SM, Aouadi M
Sci Transl Med 2020 Feb;12(532):