Antigen-specific T cell repertoires – Cassotta lab

We dissect the human T cell repertoire targeting tumor and self-antigens at the clonal level to elucidate immunodominance and immune tolerance. Learning from nature, we aim to identify therapeutically relevant T cell receptors and epitopes to advance immunotherapies.

Vår forskning

Vår forskning går ut på att analysera den mänskliga T-cellsrepertoaren för att förbättra patienters liv genom att identifiera biomarkörer och utforma nya immunbaserade terapier.

I vår forskning kartlägger vi humana T-cellskloner som riktar sig mot tumör- och självantigener för att belysa reglerna som styr immundominans, immunologiskt minne och immuntolerans i olika mänskliga sjukdomskontexter, inklusive cancer. Detaljerad analys av patienters T-cellsrepertoarer ger oss också möjlighet att identifiera terapeutiskt relevanta T-cellsreceptorer (TCR) och epitoper och att utnyttja dessa för att utforma nya terapeutiska metoder.

Vi har optimerat känsliga målagnostiska screeningmetoder för högkapacitetsisolering av antigenspecifika T-celler som känner igen naturligt bearbetade peptider från patienter (Cassotta et al., Nature Medicine 2019; PMID: 31501610), samt pipelines för djupgående karakterisering av deras TCR-sekvenser, besläktade epitoper och MHC-restriktion (Low, …, Sallusto*, Cassotta*, Science 2021; PMID: 34006597).

Genom att lära av naturen strävar vi efter att frigöra immunsystemets fulla potential för att forma framtidens immunterapi.

Lediga tjänster

Postdoktorala tjänster inom adaptiv immunitet vid cancer (upp till 2)

Vi är alltid intresserade av att hitta begåvade medarbetare till vårt team. Är du intresserad av vårt arbete? Välkommen att kontakta oss: antonino.cassotta@ki.se

Publications

All publications from group members

Funding

Grants

  • Swedish Research Council
    1 January 2026 - 31 December 2029
    Multiple myeloma (MM) is a malignancy of plasma cells that produce a uniquely rearranged monoclonal antibody, known as M-protein. The failure of the immune system to eliminate malignant plasma cells remains incompletely understood. Despite therapeutic advancements, MM remains incurable due to recurrent relapses, highlighting the urgent need for new treatment strategies. Genome editing technologies enable the development of cell-based immunotherapies with enhanced specificity and efficacy. Here, I will investigate the endogenous T cell response to MM by characterizing the specificity and function of tumor-reactive T cells within the bone marrow microenvironment. In parallel, I will identify T cell receptors (TCRs) targeting tumor antigens, including conserved idiotypic epitopes from M-proteins and recurrently mutated oncogenes, to develop novel TCR-based immunotherapies. Using precise genome editing, I will engineer TCR-transgenic T cells and natural killer (NK) cells to mitigate tumor evasion due to MHC loss. By dissecting the TCR repertoire and specificity of the endogenous T cell response in MM, this study will provide key insights into immune evasion mechanisms and enable new off-the-shelf and multiplexed TCR-based immunotherapies. The knowledge and methodologies generated in this study will not only advance treatment strategies for MM but also inform the design of next-generation precision immunotherapies against other malignancies.

Staff and contact

Group leader

Visiting address

Karolinska Institutet, H7 Medicin / NEO / HERM, Blickagången 16, Huddinge, 14152, Sweden