Genetic and epigenetic factors in asthma and allergy – Cilla Söderhäll's research group

Our main aim is to develop molecular diagnostic and prognostic tools for clinical use, that could discriminate between preschool wheezers that will develop chronic asthma and those that will grow out of their symptoms. Today, asthma cannot be efficiently predicted or prevented, and the current treatment in preschool children is not optimal and sometimes even without effect.

Återkommande episoder med andningsbesvär hos småbarn är besvärligt för dem som drabbas, och är en vanlig orsak till besök på akutmottagning och sjukhusinläggning. Ca. 30 % av dessa barn kommer att utveckla astma, medan många blir symtomfria före skolstart.

Vi strävar efter att utveckla molekylära verktyg som kan användas för såväl diagnos som prognos för denna grupp av barn. Med specifika biomarkörprofiler hoppas vi kunna förutsäga vilka barn som kommer att utveckla kronisk astma, och vilka som kommer att växa ur sina besvär. Analyserna görs dels på global nivå, dels genom riktade analyser av specifika gener och molekylära nätverk.

Utöver detta bidrar vår forskning till att öka förståelsen för det molekylära bidraget till astma, och identifieringen av olika riskfaktorer och dess påverkan, tex genetiska faktorer, infektioner och allergiutveckling. Förhoppningsvis kan den ökade förståelsen ge förbättrade behandlingsmöjligheter, och i bästa fall även helt nya molekylära angreppspunkter för astmabehandling. 

Forskningsprojekt

Gene Expression in Wheezing and Asthmatic Children

I GEWAC-studien (Gene Expression in Wheezing and Asthmatic Children) rekryterade vi under perioden 2008 till 2012 småbarn (6 mån-3 år) med akut astma på Astrid Lindgrens barnsjukhus. De 156 barnen följdes upp i symtomfri period efter ca. 3 mån och därefter med årliga besök till 7 års ålder. Besöken vid 7 års ålder avslutades under 2018, och en uppföljning vid 10-13 års ålder har påbörjats av de äldsta barnen.

Barnen i GEWAC-studien är väl karaktäriserade med klinisk undersökning, frågeformulär och provtagningar. I denna longitudinella kohort, följer vi såväl det kliniska förloppet som förekomst av virus och bakterier, allergiutveckling, som genetiska (inklusive genuttryck) och epigenetiska komponenter över tid.

Preventing Atopic Dermatitis and Allergy in Children

Utöver detta försöker vi förstå vilken påverkan genetiska faktorer har vid utveckling av eksem och födoämnesallergi, i en stor nordisk interventionsstudie med namnet PreventADALL (Preventing Atopic Dermatitis and ALLergy in children).

Vi tror att olika genetiska förutsättningar påverkar hur tålig och tät barriären i huden och luftvägarna är. En mer genomsläpplig barriär ger en ökad risk för såväl eksem som födoämnesallergi, varför förekomst av vissa genetiska varianter skulle kunna indikera en grupp där förebyggande åtgärder är av extra stort värde.

Funding

Forskningsanslag har erhållits från bland andra:

  • Hjärt-Lungfonden
  • Stockholms läns landsting, ALF
  • Stiftelsen Frimurare Barnhuset i Stockholm
  • Ellen, Walter och Lennart Hesselmans stiftelse
  • Konsul Th C Berghs stiftelse
  • Märta och Gunnar V. Philipsons Stiftelse
  • FORTE
  • Astma- och Allergiförbundet
  • Vetenskapsrådet VR: klinisk behandlingsforskning
  • Vårdalstiftelsen
  • Svenska Vetenskapsrådet

Staff and contact

Group leader

All members of the group

Pågående handledarskap doktorander

  • Angela Hoyer, MSc in Molecular Medicine, registrerad 2020, huvudhandledare Genetic and epigenetic risk factors for preschool wheeze to develop to asthma“, Karolinska Institutet
  • Anastasia Filiou, barnläkare, registrerad 2018, huvudhandledare, “From preschool wheeze to childhood asthma; the role of genetics and environmental factors“, Karolinska Institutet
  • Caroline-Aleksi Olsson Mägi, barnsjuksköterska, registrerad 2016, bihandledare, ”Maternal stress and allergic disease in her offspring”, Karolinska Institutet
  • Sandra Ganrud Tedner, barnläkare, registrerad 2018, bihandledare, “Specific IgE-profiles and allergy prediction”, Karolinska Institutet
  • Idun Holmdahl, läkare, registrerad 2018, bihandledare, “Långtidsuppföljning av småbarn som behövt akut sjukvård för luftvägsobstruktivitet: Vilka kommer få astma i skolåldern?”, Karolinska Institutet
  • Martin Färdig, barnsjuksköterska, registrerad 2018, bihandledare, “The risk of developing asthma in young children by factors related to pregnancy, birth and early lung function”, Karolinska Institutet

Tidigare handledarskap doktorander och postdocs

  • Katarina Stenberg Hammar, barnläkare, PhD 2016, huvudhandledare, ”Viral wheeze and risk factors for childhood asthma- an evaluation of clinical, immunological and genetic factors”, Karolinska Institutet,
  • Christina Orsmark Pietras, PhD 2011, bihandledare, ”Interaction and regulation of asthma susceptibility genes”, Karolinska Institutet,
  • Nathalie Acevedo, läkare, PhD 2015, bihandledare, ”Epigenetic Mechanisms of Asthma and Allergy”, Karolinska Institutet,
  • Lovisa E Reinius, post doc, 2009-2013; bihandledare, Karolinska Institutet, Genetics and epigenetics in asthma
Keywords:
Medical Epigenetics and Epigenomics Medical Genetics and Genomics Pediatrics Respiratory Medicine and Allergy
Content reviewer:
22-03-2024