KI Biobank - provhanteringstjänster
KI Biobanks corefacilitet erbjuder en rad flexibla servicealternativ som är skräddarsydda för att möta våra kunders behov. Våra pålitliga och säkra servicelösningar gör det möjligt för oss att plocka ut och bearbeta prover efter behov, samtidigt som vi strävar efter att överträffa förväntningarna. Vi erbjuder både automatiserad och manuell provhantering.
Automatiserad hantering
Våra robotplattformar erbjuder robitiserad provhantering med hög kapacitet. KI Biobanks automatisering inkluderar plattformar från Roche, Tecan, Hamilton, Qiagen och Revvity (PerkinElmer).
De automatiserade processerna sorterar och alikvoterar prover enligt kundernas behov, och inkluderar sortering, centrifugering, alikvotering och lagring.
Vi hanterar olika provtyper och erbjuder olika alikvoteringsformat.
Proverna alikvoteras på robotar med ett protokoll för 8 till 16 alikvoter på 225 µl per alikvot.
Provtyper som alikvoteras:
- Cell-free plasma från Streck- och EDTA-rör
- EDTA-plasma
- Cerebrospinalvätska
- Navelsträngsblod
- Serum
- Urin
Manuell hantering
Ibland är vissa projekt helt enkelt inte automatiserbara. Därför erbjuder KI Biobank manuell bearbetning av prover.
Prover följer protokoll som tillgodoser kundernas önskemål. Alla manuella hanteringsprocesser utförs enligt studieprotokollet för att bevara den analyt som är av intresse. Alla manuella processer hanteras i en kontrollerad miljö för att skydda proverna och personalen. Alikvotering av manuella prover beror på protokollet och volymen varierar från 500 µl till 15 ml för olika rörtyper såsom kryorör, kryopurerör etc.
Provtyper som alikvoteras:
- Cellfree plasma från Streckrör
- Trombocytutarmad plasma från EDTA-rör
- EDTA-plasma
- Cerebrospinalvätska
- Cellfree RNA-plasma
- PBMC isolering
- Serum
- Urin
DNA extraktion
Vi erbjuder olika extraktionsprotokoll för olika provtyper.
Vår extraktionsprocess för genomiskt DNA hanteras automatiskt med hjälp av robotar med hög extraktionskapacitet.
• DNA kan extraheras från helblod, buffy coat och saliv. Varje DNA-prov genomgår en koncentrationsmätning och normalisering är tillgänglig på begäran.
• DNA från cellfri plasma och parafininbäddad vävnad kan också extraheras.
Kontakta KI Biobank för mer information om provtagningsrörstyper, volymer av ingående prov etc.
PBMC Isolering
Vi erbjuder cellisolering från perifera mononukleära blodceller (PBMC) från benmärg och helblod.
Vi erbjuder olika isoleringsprotokoll beroende på kundens önskemål. Isoleringsprocessen utförs i en steril BSL-2-miljö med hjälp av en laminär luftflödeshuv. Våra mest populära isoleringsprotokoll är densitetsgradientcentrifugering med antingen Ficoll eller Lymphoprep.
Förvaring
Vi förstår vikten av att bibehålla provernas kvalitet och stabilitet. Vi gör vårt yttersta för att säkerställa optimala förvaringsförhållanden för varje provtyp. Våra förvaringstjänster tillgodoser en mängd olika behov och erbjuder anpassningsbara lösningar för att tillgodose nästan alla typer av prover.
Prover som behandlas på KI Biobank kan förvaras vid rumstemperatur, -20℃, -80℃ eller -180℃ enligt kundens rekommendationer. Vi har också ett toppmodernt automatiserat system för provlagring och utplock av prov som kan lagra prover vid -80℃ och är smidigt för snabba uttag.
Prover som behöver förvaras vid -180℃ förvaras i våra tankar med flytande kväve (LN2).
För att säkerställa dina provers säkerhet har KI Biobank strikta åtgärder för att skydda dem. Vi har ett larmövervakningssystem dygnet runt med en jourhavande person som svarar på samtalet och vidtar omedelbara åtgärder vid fryslarm och nödsituationer utanför arbetstid, helger och helgdagar.
Uttag av prov
På KI Biobank har du snabbt och enkel tillgång till prov. Prover plockas ut på kundens begäran. Vi erbjuder omformatering av olika provtyper till olika format.
För att välja ut prover från din provsamling, fyll i formuläret Withdrawal Order. Du behöver också förbereda en Excel-fil med provgivar-ID. Provgivar-ID:t kan vara en av två typer, antingen Customer Donor Key (CDK) eller Referral ID (RID).
Withdrawal Order, med huvudansvarig forskares underskrift, ska skickas via e-post till biobank@ki.se. Du kommer att få inloggningsuppgifter till en server så att du kan ladda upp din fil med provgivar-ID.
Om dina prover ska skickas för analys behöver du ha ett Material Transfer Agreement (MTA).
Uttag från LifeGene eller EpiHealth
LifeGene och EpiHealth är två unika studier som syftar till att fördjupa vår kunskap om hur våra gener och vår miljö interagerar vid olika sjukdomar. Båda kohorterna inkluderar prover, analyserade provdata, genotypdata och enkätdata redo för uttag efter etiskt godkännande.