Tomas Ekströms forskargrupp

This page in English

Medicinsk epigenetik

En korrekt tolkning av arvsmassan är nödvändigt för en normal funktion av celler, organ och individ. Epigenetiken, som formar epigenomet, är länken mellan arvsmassan och den yttre miljön. Varje yttre stimulus påverkar det genregulatoriska maskineriets förmåga att tolka epi-genomet, genom förändringar i den fysiska kromatinstrukturen.

Forskargruppen har två huvudsakliga intressen:

Epigenetiska mekanismer kring cytomegalovirusinfektion
Cancer har länge betraktats som enbart en genetisk sjukdom, som uppstår genom mutationer i en eller flera viktiga gener. Ny kunskap har förändrat denna förenklade bild. Förändringar i epigenomet uppträder alltid tidigt i cancerutveckling, vilket har bildat grunden för hypotesen att epigenetiska förändringar är viktiga för både uppkomst och tillväxt av cancer. Cancer kan därför vara både en genetisk och en epigenetisk sjukdom. Gruppen forskar kring frågor om epigenetiska mekanismer för uppkomsten av cancer. Vi är speciellt intresserade av hur virus kan medverka i förändringar av epigenomet som kan leda till att cellers arvsmassa misstolkas och därmed öka risken för cancer.

Epigenetiska analyser av mekanismer kring arv/miljö interaktioner som leder till reumatoid artrit och multipel skleros
Kroniskt inflammatoriska sjukdomar drabbar 1/3 av vår befolkning med en stor börda för samhälle och individer. Faktorer som ligger bakom individuella sjukdomsrisker och terapisvar är av stort intresse. Samverkan mellan arvsmassans gener, och dess epigenetiska profil är san-nolikt av avgörande betydelse.

Reumatoid artrit (RA), en autoimmunologiskt skapad, kronisk inflammation som orsakar för-störelse av ben och brosk i leder, med påföljande funktionshandikapp drabbar i Sverige 25 personer/100.000 /år. Multipel skleros (MS) som också har autoimmunt ursprung drabbar 500 nya patienter årligen i Sverige.

Vi studerar länken mellan arvsmassan och den yttre miljön, med epigenetiska tekniker, och kopplar epigenetiska profiler till genetisk bakgrund, livsstilsfaktorer och sjukdomsrisker. Vi vill hitta molekylära orsaker till att människor med en viss genuppsättning och en viss miljö-exposition (t.ex. rökning) drabbas av RA eller MS och varför terapisvar skiljer sig mellan individer. För detta använder vi ny teknik med material från patienter med RA och MS. Forskningen finansieras fr.a. av AFA Försäkring.

Forskningsprojekt

  • Epigenetiska mekanismer kring cytomegalovirusinfektion
  • Epigenetiska analyser av mekanismer kring arv/miljö interaktioner som leder till reumatoid artrit och multipel skleros

Utvalda publikationer

Cesarean delivery and hematopoietic stem cell epigenetics in the newborn infant: implications for future health?
Almgren M, Schlinzig T, Gomez-Cabrero D, Gunnar A, Sundin M, Johansson S, et al
Am. J. Obstet. Gynecol. 2014 Nov;211(5):502.e1-8

Epigenome-wide association data implicate DNA methylation as an intermediary of genetic risk in rheumatoid arthritis.
Liu Y, Aryee M, Padyukov L, Fallin M, Hesselberg E, Runarsson A, et al
Nat. Biotechnol. 2013 Feb;31(2):142-7

Human cytomegalovirus infection is sensitive to the host cell DNA methylation state and alters global DNA methylation capacity.
Esteki-Zadeh A, Karimi M, Strååt K, Ammerpohl O, Zeitelhofer M, Jagodic M, et al
Epigenetics 2012 Jun;7(6):585-93

Epigenetic aberrations in leukocytes of patients with schizophrenia: association of global DNA methylation with antipsychotic drug treatment and disease onset.
Melas P, Rogdaki M, Ösby U, Schalling M, Lavebratt C, Ekström T
FASEB J. 2012 Jun;26(6):2712-8

Genomic DNA hypomethylation by histone deacetylase inhibition implicates DNMT1 nuclear dynamics.
Arzenani M, Zade A, Ming Y, Vijverberg S, Zhang Z, Khan Z, et al
Mol. Cell. Biol. 2011 Oct;31(19):4119-28

Gruppmedlemmar

Ali Alavian GhavaniniPostdoc
Malin AlmgrenForskarassistent
Tomas EkströmForskargruppsledare, Professor
Atosa EstekizadehDoktorand, Forskarstuderande
Andrew FeinbergAnknuten
Philippe MelasAnknuten
Mikael RinghDoktorand, Forskarstuderande
Joelle RüeggForskare
Louise SjöholmForskarassistent

Klinisk neurovetenskap