Qiang Pan Hammarström

Syftet med vårt forskning är att förstå de komplexa, molekylära mekanismer som är involverade i processerna som arrangerar om DNA:t under klass switch rekombination (CSR) och somatisk hypermutation (SHM).

För projektet är vi beroende av material från patienter med medfödda sjukdomar, orsakade av fel i olika proteiner som lagar DNA-skador. Dessa sjukdomar är mycket ovanliga, men tack vare internationella samarbeten har vi lyckats få tillgång till prover från flera av dessa patienter. Vi arbetar också med att förbätta och ta fram nya metoder för att upptäcka personer som lider av dessa sjukdomar.

Vi har utvecklat en rad olika PCR-baserade metoder, med vilka vi kan studera hur två DNA-regionerhar sammankopplats under CSR och hur mutationsmönstret ser ut skapat genom SHM, hos immunoglobuliner i mänskliga B-celler. Vi håller också på att ta fram en metod där vi kan mäta CSR-aktiviteten kvantitavit med hjälp av GFP-uttryck. Genom att kombinera flera tillvägagångssätt hoppas vi kunna kartlägga vilka olika reparationsmekanismer som är invovlerade i CSR och SHM.

Slutligen vill vi besvara frågan huruvida misstag som sker under CSR är sammankopplat med en ökad risk att utveckla lymfom hos patienter med immunbrist och/eller fel i reparationen av DNA-skador. För att ta reda på detta analyserar vi brott i kromosomerna orsakde av CSR och translokationer hos dessa patienter. Dessutom har vi startat ett storskaligt cancerprojekt där vi använder den senaste generationens sekvenseringsmetoder för att karakterisera CSRnomet hos B-celler i lymfomprover.

Vår forskning är finansierad av Vetenskapsrådet (VR), Cancerfonden och European Research Council (ERC).

Qiang Pan Hammarströms forskargrupp har sin verksamhet på Karolinska Institutet i Flemingsberg, Alfred Nobels Allé 8, plan 7, Institutionen för Laboratoriemedicin ("Tandläkarhuset").

Forskargruppledare

Forskargruppens medlemmar

• Utvalda publikationer (Pdf-fil, 89 Kb)

Qiang Pan-Hammarströms Forskargrupp